Розмір логічного блоку грає важливу роль. У деяких системах (Unix) він може бути заданий при форматуванні диска. Невеликий розмір блоку приводитиме до того, що кожен файл міститиме багато блоків. Читання блоку здійснюється із затримками на пошук і обертання, таким чином, файл з багатьох блоків читатиметься поволі. Великі блоки забезпечують вищу швидкість обміну з диском, але із-за внутрішньої фрагментації (кожен файл займає ціле число блоків, і в середньому половина останнього блоку пропадає) знижується відсоток корисного дискового простору.
Для систем із сторінковою організацією пам'яті характерна схожа проблема з розміром сторінки.
Проведені дослідження показали, що більшість файлів мають невеликий розмір. Наприклад, в Unix приблизно 85% файлів мають розмір менше 8 Кбайт і 48% - менше 1 Кбайта.
Можна також врахувати, що в системах з віртуальною пам'яттю бажано, щоб одиницею пересилки диск-пам'ять була сторінка (найбільш поширений розмір сторінок пам'яті - 4 Кбайта). Звідси звичайний компромісний вибір блоку розміром 512 байт, 1 Кбайт, 2 Кбайт, 4 Кбайт.