По типу питания бактерии подразделяются на аутотрофов и гетеротрофов. Аутотрофы способны усваивать углерод из СО2.
Гетеротрофы усваивают углерод только из органических соединений.
Гетеротрофы в свою очередь подразделяются на сапрофитов и паразитов. Сапрофиты – свободноживущие микроорганизмы, в качестве питательных веществ используют органические соединения погибших организмов или продукты их жизнедеятельности. Средой обитания бактерий-паразитов является живой организм. Бактерии паразиты являются патогенными, т.е. болезнетворными. Бактерии-симбионты обитают в кишечнике человека и животных и выполняют жизненно-важные функции для организма хозяина.
Изменчивость в потребностях метаболитов. Под влиянием антибиотиков и химических веществ, Х-лучей, ультрафиолетового облучения и других воздействий у некоторых микробов появляется потребность в определенных аминокислотах, факторах роста, в которых не нуждались исходные культуры. Такие варианты, которые для своего развития нуждаются в специальных веществах, называют ауксотрофами в отличие от исходных штаммов — прототрофов. Ауксотрофы отличаются от про-тотрофов тем, что у них часть метаболических процессов блокирована и они лишены возможности синтезировать необходимые им метаболиты. Так, например, после воздействия на Е. соН Х-лучей она стала нуждаться для своего роста в гйдролизате казеина или экстракте дрожжей, в то время как исходный штамм мог развиваться в минимальной среде, в которой отсутствовали аминокислоты и витамины. Ауксотроф-ность можно воспроизвести и в отношении триптофана, антра-ниловой кислоты, пенициллина и других веществ.
Физические и химические факторы могут индуцировать различные изменения способности синтеза важных метаболитов в бактериальных культурах. Эти изменения происходят под влиянием механизмов генетической информации.