Следующий этап – разработка планов и методик научных исследований, постановка эксперимента, сбор и анализ экспериментальных данных. Ориентирами в этом служат общие правила проведения научных исследований по биологии. Цифровой материал, полученный в опытах, обрабатывают методом вариационной статистики, сводят в таблицы, диаграммы, графики, рисунки (рис. ). Полученные результаты анализируют, сопоставляют с литературными данными и делают научно - обоснованные выводы. В процессе накопления и обработки материала, выпускные квалификационные работы дополняют чертежами, фотографиями, рисунками и др. Студентам при проведении опытов, сборе материалов, обработке и анализе полученных данных необходимо обращаться за консультациями к своим руководителям, преподавателям других кафедр и специалистам предприятий, где проходила преддипломная практика.
В зависимости от темы выпускных квалификационных работ руководители студентов имеют право передать в деканат представления о назначении консультантов из числа преподавателей или научных сотрудников соответствующего профиля.