Всі форми квасолі звичайної диплоїдні (2n = 22). Генетика цієї культури вивчена вкарай слабо. Нема ймовірної інформації про закономірності спадкування як якісних, так і кількісних ознак. Лише в окремих роботах наводяться деякі відомості з цих питань. Так, встановлено, що при схрещуванні білонасіневих і забарвлених форм усе насіння в першому поколінні буває забарвленим, а характер розподілу в F2 і прояв форм з забарвленим насінням при схрещуванні двох білонасіневих сортів свідчить про полігенне спадкування цієї ознаки. Плямисте забарвлення насінин обумовлено одним домінантним геном.
Кількісні ознаки квасолі - число і маса бобів і насінин на одній рослині – сильно модифікуються умовами середовища, що маскує генотипічні взаємообумовленості.