ЕС располагает собственными финансовыми средствами независимо от бюджетов входящих в него стран. Размер бюджета ЕС определяется Советом и Европарламентом и утверждается последним.
Важную роль в финансовой деятельности играет Счетная палата, осуществляющая общее финансовое управление, контроль над расходами различного рода фондов и финансовых институтов ЕС, таких, например, как Европейский фонд аграрной ориентации и гарантирования, Европейский фонд регионального Развития, Европейский социальный фонд. За счет средств указанных фондов финансируются различные направления структурной политики ЕС: аграрная, социальная, региональная, энергическая и т.д. Европейский инвестиционный банк, являясь автономной организацией, финансирует капиталовложения ЕС региональные программы, развитие энергетики, инфраструктуры путем долгосрочных кредитов и гарантий.
Доходная часть бюджета состоит, во-первых, из собственных средств, которые складываются из ввозных пошлин, компенсирующих разницу в ценах на сельскохозяйственные продукты в сортирующей стране и на внешнем рынке; таможенных пошлин по общему таможенному тарифу, исключая пошлины ЕОУС; определенной части отчислении от налога на добавленную стоимость и прочих средств. Во-вторых, в доходную часть бюджета ЕС выделяется 1,2-1,3% ВВП всех входящих в ЕС государств.
Расходы ЕС распределяются в последние годы примерно следующим образом (%):
административно-хозяйственные 4,5
на проведение политики:
единой сельскохозяйственной 66,5
региональной 7,5
социальной.... 6,6
энергетической 0,3
промышленной 0,1
научно-технической 3,5
в области информации и охраны окружающей среды 0,08
помощи развивающимся странам 2,1
на компенсационные выплаты государствам-членам ЕС 8,4