В апреле 1987 г. Microsoft и IBM начали совместную разработку новой операционной системы OS/2. Под эту ОС специально была разработана файловая система, призванная обеспечить стабильную и быструю работу с диском и облегчить труд администраторов.
Но некоторые разногласия компаний привели к тому, что в сентябре 1990 г. сотрудничество было прекращено и каждый пошел своей дорогой.
В результате мир получил OS/2 и файловую систему HPFS (High Perfomance File System) от IBM и Windows NT с файловой системой NTFS (New Technology File System) от Microsoft.
У файловых систем было много общего, и до версии Windows NT 3.51 включительно Microsoft обеспечивала в своих операционных системах поддержку HPFS.
На сегодняшний день из семейства Windows файловую систему NTFSподдерживают только те операционные системы, которые базируются на ядре NT. Это Windows NT 3.xx, Windows NT 4.0, Windows 2000 и Windows XP.