Базисом NTFS является главная таблица файлов (Master File Table, MFT).
MFT изначально резервирует под себя одну восьмую часть раздела (примерно 12%). Если место на разделе заканчивается, MFTсокращается в два раза, освобождая для файлов пользователя свободное пространство. Процедура может повторяться несколько раз. При появлении незанятого места MFT снова резервирует под себя 12% от объема раздела, что приводит к нежелательному эффекту - фрагментации MFT. При этом эффективность работы с NTFS-диском падает.