Соматические мутациипроисходят в соматических клетках, передаются по наследству только при вегетативном размножении и проявляются у самой особи (разный цвет глаз у одного человека, белая прядь волос, опухоли). Эти мутации затрагивают лишь часть клеток и мозаично проявляются в фенотипе. Потомство одной мутантной соматической клетки называется клоном. Особи, несущие соматическую мутацию называются мозаиками или химерами.Соматические мутации не играют какой-либо роли в процессе эволюции, поскольку при размножении половым путем не закрепляются в потомстве. Однако в селекции часто используют такие мозаики, у которых проявились хозяйственно полезные признаки и свойства. Например, И.В. Мичурин из соматической мутации (на дереве обычной антоновки развилась ветвь с очень крупными плодами) вывел сорт Антоновки шестисотграммовой.
Нарушения наследственных структур в половых клетках на разных стадиях гаметогенеза называются генеративными мутациями (гемофилия, фенилкетонурия). При их возникновении на ранних стадиях гаметогенеза мутантная клетка может размножиться и в потомстве появится ряд особей с одинаковым мутантным фенотипом. Несколько одинаковых мутаций можно наблюдать у особей, дающих многочисленное потомство (растения, насекомые, мыши, кролики и др.). Такие мутации называют «пучковыми».
Генеративные мутации наследуются при половом размножении и играют роль в эволюции. Они изменяют физиологические и биохимические свойства организма и оказывают влияние на его жизнеспособность.