Для обозначения совокупности действий, выполняемых файловой операцией, используется термин «транзакция». Для сохранения целостности транзакция должна выполняться целиком или не выполняться вообще. Одним из средств поддержки целостности является журналирование. Последовательность действий с объектами протоколируется. В журнал заносятся лишь изменения метаданных. При нарушении целостности можно обратиться к проверке диска. Для решения проблем плохих блоков используется список плохих кластеров.