Признайте право консультанта на интимность этой части его работы с Вашими подчиненными. Постарайтесь создать ему условия для этого. Например: разошлите письменные распоряжения руководящему составу вашей организации о том, что консультант по управлению начинает у Вас организационную диагностику и Вы просите всех сотрудничать с ним в этом деле. Консультант поможет Вам составить текст такого распоряжения. Отведите консультанту кабинет для проведения интервью или позвольте ему занять переговорную комнату. Не требуйте от него раскрытия конфиденциальной информации.
А вот на что Вы вправе рассчитывать - так это промежуточные результаты оргдиагностики, в данном случае - список проблем организации. Наверняка этот консультационный продукт составит для Вас ценную новизну. А дальше - ждите отчета.
А чего бы я не посоветовал руководителю - самому не проводить диагностическое интервью со своими подчиненными. Для них Вы всегда есть определенная позиционность - и объективно, и субъективно Вы - контролер их работы. И конфиденциальность между вами невозможна. Словом, не директорское это дело.