Анализ данных государственного мониторинга земель и других систем наблюдений за состоянием окружающей природной среды показывает, что состояние качества земель интенсивно ухудшается. Почвенный покров, особенно пашни и других сельскохозяйственных угодий, продолжает подвергаться деградации, загрязнению, захламлению, воспроизводству плодородия вследствие истощительного и потребительского использования земель.
По данным государственного учета земель на сельскохозяйственных угодьях, отнесенных к категории земель сельскохозяйственного назначения более 56 % площади подвержены негативным природным процессам.
Из общей площади сельскохозяйственных угодий (1243,3 тыс.га) процессами заболачивания охвачено 24% земель, переувлажнению – 19%, подвержено опасности водной эрозии – 11%, ветровой эрозии – 2%.
В последние десятилетия в Западной Сибири постепенно стали расширяться масштабы и виды использования болот и заболоченных земель, занимающих более трети всей территории. При этом возник целый ряд проблем, пока не имеющих решений, в том числе проблема расчета предельно допустимых сбросов (ПДС) загрязняющих веществ в болота. Специфика этой проблемы обусловлена огромными масштабами болотного процесса, широким распространением верховых болот и слабой изученностью гидрохимического режима болот, что обусловливает актуальность исследований химического состава болотных вод и его изменений под влиянием антропогенных факторов. Подобные исследования проводятся в течение ряда лет в ОГУП Территориальный центр «Томскгеомониторинг», Томском политехническом и государственном университетах, Сибирском НИИ торфа.
Среднегодовая добыча пресных подземных вод составляет 142 млн. куб.м., что в 20 раз превышает добычу нефти. В настоящее время практически все население области использует для питья только подземные воды. Тем не менее, используется менее 1% их ресурсов.
В области распространены почвы восьми основных типов: подзолистые, подзолисто-болотные, серые лесные, серые лесные глеевые, черноземы, черноземно-луговые, болотные и пойменные.
Кроме того, по данным Института проблем жилищно-коммунального хозяйства в районах Севера, Сибири и Дальнего Востока, на территория Томской области подвержено подтоплению 1826,2 тыс. га (или 5,8% земельного фонда области).
Среди подтопленных территорий сельскохозяйственные угодья составляют 17,7% (324,1 тыс.га), леса и древесно-кустарниковые насаждения – 34,3% (626,6 тыс. га), болота – 47,9% (874 тыс.га), застроенные территории поселений – 0,1% (1,5 тыс. га).
Целенаправленных работ по вопросу подтопления земель не проводилось. Территории подтопленных земель были вычислены по имеющимся фондовым геологическим материалам.
Переувлажненные и заболоченные земли занимают 43% площади сельскохозяйственных угодий (537,0 тыс.га).
По состоянию на 01.01.2012 года в области числится 7,0 тыс.га нарушенных земель, подверженных тому или иному негативному воздействию (с учетом материалов статистического наблюдения форма 22-2). К данным землям относятся земли, утратившие первоначальную природную, хозяйственную и социальную ценность, являющиеся источником отрицательного воздействия на окружающую среду в связи с нарушением почвенного и растительного покроя, земли для разработки карьеров по добыче полезных ископаемых (торфа, песка, глины).