Окисление ненасыщенных жирных кислот в принципе происходит так же, как и окисление насыщенных жирных кислот. Однако здесь имеются некоторые особенности. Двойные связи природных ненасыщенных жирных кислот (олеиновой, линолевой) имеют цис-конфигурацию, а в КоА-эфирах ненасыщенных жирных кислот, двойные связи имеют транс-конфигурацию. Кроме того, последовательное удаление двууглеродных фрагментов при окислении ненасыщенных жирных кислот до первой двойной связи дает 3,4-ацил-КоА, а не 2,3-Ацил-КоА, который является промежуточным продуктом при -окислении насыщенных жирных кислот.
В тканях существуют ферменты, которые осуществляют перемещение двойной связи из положения 3,4 в положение – 2,3, а также изменяют конфигурацию двойной связи из цис-положения в транс-положение:
СН3-(СН2)7 – СН = СН – (СН2)7 – СООН + АТФ + НSКоА
олеиновая кислота
СН3 – (СН2)7 – СН = СН – (СН2)7 – СОSКоА + АМФ + ФФн
оленоил – КоА -окисление
3СН3 – СОSКоА + СН3 – (СН2)7 – СН = СН – СН2 – СОSКоА
3,4 – цис – еноил – КоА
СН3 – (СН2)7 – СН2 – СН = СН – СОSКоА
-окисление 2,3 – транс – еноил – КоА
6СН3 – СОSКоА