Главный вопрос, который встает при рассмотрении биологических явлений, даже такого масштаба как процесс эволюции организмов, сводится в самом общем виде к следующему: является ли это явление естественным процессом, т.е. процессом перехода системы из менее вероятного в более вероятное состояния, или оно осуществляется под влиянием особых причин или законов нефизического характера, т.е. является по нашему определению (Зотин, Зотина, 1993) неестественным процессом. В рамках материалистических представлений кажется очевидным, что эволюция организмов представляет собой естественный процесс. Естественные физико-химические процессы в феноменологическом плане описываются термодинамикой неравновесных процессов. Поэтому второй вопрос, который следует решить при построении теоретических основ эволюционного учения, сводится к вопросу о применимости в этом случае основных соотношений и методологии термодинамики неравновесных процессов. Этот вопрос всегда вызывал ожесточенные споры, но в последнее время он потерял остроту, так как появилось большое число исследований, показывающих плодотворность термодинамики, как основы для дальнейшего развития эволюционного учения (Коноплев, Зотин, 1975; Коноплев и др., 1975; Зотин, Коноплев, 1976; Wicken, 1979, 1980, 1985, 1986, 1987; Зотин, Криволуцкий, 1982; Wiley, Brooks, 1982, 1983; Зотин, 1984; Brooks, 1984, 1986; Brooks et al., 1984; Brooks, Wiley, 1984, 1988; Leuschner, 1989; Swensen, 1989, 1992, 1997; Zotin, 1990; Голубев, 1991; Зотин,
Зотина, 1993; Зотин, Зотин, 1995; Zotin, Zotin, 1996). Соответственно в данной книге принимается, что многие проблемы макро- и мегаэволюции можно решать опираясь на соотношения и методологию термодинамики неравновесных процессов. Исходя из этого, уместно было бы кратко напомнить основные положения термодинамики неравновесных процессов.