Благодаря разрушающему (литическому) действию на бактерии фаги могут быть использованыс лечебно - профилактической целью при различных заболеваниях (дизентерия, холера, гнойно-воспалительные заболевания и другие)
Наборы стандартных фагов используются для фаготипирования(определения типа, выделения) возбудителей ряда заболеваний (холеры, брюшного тифа, сальмонеллёзов, дифтерии, стафилококковых инфекций и других).
Фаги используют для изучения генетики микроорганизмов.