Процесс трансформации может самопроизвольно происходить в природе, особенно у грамположительных бактерий, когда ДНК из погибших клеток захватывается реципиентными клетками.
Благодаря трансформации показано, что ДНК из патогенных (имеющих капсулу) пневмококков, может трансформировать непатогенные (некапсулированные) пневмококки в патогенные.
На различных видах микроорганизмов (синегнойная палочка, менингококки, кишечная палочка и другие) установлено, что при трансформации передаются гены, отвечающие за резистентность (устойчивость) к антибиотикам и другие свойства.
С помощью трансформации было впервые доказано, что именно ДНК служит носителем генетической информации. В настоящее время трансформация является приёмом в генной инженерии, используемым при конструировании штаммов с заданным геномом.