Файл, который занимает на диске более одного непрерывного участка, называется фрагментированным.
Фрагментация диска- это появление на диске множества свободных участков, разделенных занятыми участками.
Дефрагментация диска - это перемещение данных на разделе, после которого, кластеры содержащие части одного файла, размещаются последовательно.
Файловые системы FAT выделяют для записываемых на диск файлов некоторое количество кластеров, в зависимости от размера файла.
В процессе работы с диском при записи и удалении файлов разного размера на диске появятся свободные и занятые области разной длины.
Такой метод хранения файлов позволяет использовать всё имеющееся на диске свободное место, т.к. если длина записываемого файла больше, чем размеры непрерывных свободных участков, то файл просто расположится в нескольких несмежных участках.
Реально время чтения сильно фрагментированного файла по сравнению с файлом, занимающим непрерывную область на диске, может отличаться в несколько раз! Внешне это выглядит так, как будто все программы стали работать в несколько раз медленнее, при этом наблюдается интенсивное перемещение головок диска от одного участка файла к другому.