Если вход в систему прошел успешно, на экран будет выдана подсказка "shell" - командной оболочки (например ``#'' или ``$''). Но существует ряд проблем, которые могут возникнуть в начале использования системы.
Одна из наиболее типичных начальных проблем, связанных с конфигурированием - установка неверных прав доступа (защиты) файлов и каталогов. Это может выразиться в сообщении: Shell-init: permission denied, которое будет напечатано после входа в систему (на самом деле, всегда, когда вы столкнетесь с сообщением ``permission denied''("обращение запрещено") вы можете быть с высокой вероятностью уверены, что это проблема защиты файлов).
Во многих случаях это простое дело для команды "chmod", которая может менять права доступа к соответствующим файлам и каталогам. Но, чтобы ввести эту команду, вы должны загрузиться со средства инсталляции и примонтировать вашу корневую файловую систему Linux вручную.
Во время эксплуатации системы вы можете попадать в места, где неверно установлена защита файлов и каталогов или программы работают не так, как конфигурировались. Хотя многие дистрибутивы и не доставляют особых хлопот, лишь немногие из них безупречны.