При конфликте целей перед ГЭП встает задача выделения их обоснованных приоритетов и принятия компромиссных решений. Возможности нахождения компромиссов между противоречащими друг другу целями разные. Между одними это сделать легче, между другими - на грани возможного. Оценка важности и ранжирование целей производятся в соответствии с важнейшими групповыми интересами и историческим опытом в конкретной стране и являются объектами политической борьбы. Отношения между целями могут быть не однозначными, а, например, конфликтно-гармоничными, как например, между хозяйственным ростом и стабильностью цен.
Существуют взаимоисключающие цели, не допускающие компромиссов между собой вообще. Так, поощрение централизации капитала и создания картелей исключает поддержание свободной конкуренции. Итак, в дереве целей наряду с отношениями подчинения существуют отношения взаимосвязи, соподчинения, противоречия и взаимоисключения.