Мусульмане не были долго едиными после смерти Мухаммеда. Первый серьезный раскол произошел из-за борьбы за халифат, т. е. вскоре после убийства халифа Али и затем его сыновей, которые были внуками Мухаммеда. Следует помнить, что наследники были не только религиозными вождями, но и главами империи. Они пользовались большой светской и духовной властью. В результате раскола появилось два главных течения в мусульманстве: одно под названием суннитов, а другое шиитов. Остальные деления произошли путем отхода от этих главных течений.
Сунниты являются самой большой группой в исламе. Сунниты признают законность всех первых четырех халифов. К суннитской ветви ислама в бывших республиках СССР принадлежат узбеки, казахи, киргизы, таджики и туркмены. По сравнению с суннитами шииты составляют одну треть их числа. Они отделились от главного течения преимущественно потому, что считали, что халифами, или наследниками Мухаммеда, должны быть прямые его потомки. На этом основании они признают только последнего из четырех первых халифов - Али. Первых же трех считают захватчиками. Борьба за халифат привела к дальнейшим трагедиям. Сыновья Али, несмотря на то, что они были внуками Мухаммеда, тоже погибли, как и их отец. Хасан был отравлен, а Хусейн убит.
Для шиитов эти события имеют особое значение. Во время правления Аббасидов шииты развили теорию об особом мессианском превосходстве своих лидеров, называемых словом имам. Эти имамы были потомками Хасана и Хусейна. По этой теории, последний двенадцатый имам скрывается в пещере и будет жить до конца мира. Он называется "скрытым имамом" или Имам-ал-Махди (махди - спаситель). Его явление будет связано с воцарением праведности и мира на земле, перед тем как свершится последний страшный суд. Коренное население Азербайджана принадлежит к ветви шиитов.
Из других разных течений в исламе следует упомянуть суфистов и ваххабитов. Первое началось в Х в. и представляет монашеское и аскетическое движение, практикующее религиозный экстаз с помощью таких приемов, как музыка и пляски. Последователи суфийского учения - дервиши (странствующие монахи) - применяют в своих молебствиях экстатические пляски и другие, подобные способы общения с божеством.
Второе движение было основано в XVIII в. реформатором по имени Ваххаба, который призывал мусульман к восстановлению ортодоксального ислама. Влияние ваххабитов до сих пор сильно в Аравии и в Северной Индии.