Реакторное. июня 1948 года был пущен первый в стране и на Евразийском континенте уран-графитовый промышленный реактор для наработки оружейного плутония. Всего на комбинате в разные годы были введены в эксплуатацию 10 реакторов разной модификации, 8 из которых остановлены до 1991 года. Сегодня на ПО «Маяк» действуют два промышленных реактора третьего поколения: легководный «Руслан» (с 1979 года) и тяжеловодный «Людмила» (с 1988 года). Оба реактора обладают уникальными нейтронно-физическими характеристиками и позволяют получать широкую номенклатуру радиоактивных изотопов.
Реактор «Людмила» в настоящее время в значительной степени ориентирован на выпуск изотопной продукции для народного хозяйства. Проводятся работы по конверсии реакторной установки «Руслан». Освоен выпуск конверсионной продукции с применением процессов облучения.
Организованы участки производства термоусаживающейся трубки и радиационного легирования кремния, производятся светознаки и светоэлементы на основе трития. Значительная часть продукции реакторного производства реализуется на мировом рынке. Расширение технологий ПО «Маяк» не только в традиционном плане можно считать достаточно привлекательным для предприятия. В постперестроечные годы на одном из заводов «Маяка» на основе уникальных технологий было освоено производство микросветоэлементов прицельных приспособлений для общевойскового стрелкового оружия - автоматов, пулеметов и пистолетов.
Использование прицельных приспособлений позволяет существенно повысить эффективность применения стрелкового оружия в сумерках и в ночное время. Широкое применение находит сверхточная продукция. Автономность, надежность, безопасность радиолюминесцентных источников света ставит их вне конкуренции во многих областях применения. По индивидуальным заказам появляются светознаки, предназначенные для информирования о путях эвакуации и местах расположения средств пожаротушения.