1. Ферменты имеют более высокую каталитическую активность (выше в млн. раз);
2. Каталитическая активность проявляется в очень мягких условиях (умеренные температуры 37-40 ºС, нормальное давление, близкие к нейтральным значения рН среды 6,0÷8,0). Например, гидролиз белка в присутствии неорганических кислот и щелочей протекает при 100 ºС и выше в течение нескольких десятков часов. При участии ферментов этот процесс протекает за десятки минут при 30÷40 ºС;
3. Ферменты обладают высокой специфичностью действия, т.е. каждый фермент катализирует в основном только строго определенную химическую реакцию (например, платина катализирует несколько десятков химических реакций);
4. Активность ферментов в клетках строго контролируется и регулируется;
5. Не вызывают каких-либо побочных реакций;
6. Различия связанные с белковой природой ферментов (термолабильность, зависимость от рН среды, наличие активаторов и ингибиторов и др.).