Структура грамицидинового канала, его фундаментальное и практическое значение

www trunk.5ballov.ru data referats downloads new tmp dir 4 Соглашение об использовании Материалы данного файла могут быть использованы без ограничений для написания собственных работ с целью последующей сдачи в учебных заведениях.Во всех остальных случаях полное или частичное воспроизведение, размножение или распространение материалов данного файла допускается только с письменного разрешения администрации проекта 1. 2 3 4 4.1 4.2 4.3 ? 2 Bacillus Brevis, 1 15 ? 2 ? L D- 3 N D 11 11 Trp, B Phe Tyr. HCO- L Val-Gly- L Ala- D Leu- L Ala- D Val- L Val- D Val- L Trp- D Leu- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 X- D Leu- L Trp- D leu- L Trp-NH2CH2CH2OH 11 12 13 14 15 ? L-Trp L-Phe L-Tyr 85 5 15 ? 90 ? Val 10 Ile. 6 S , Bacillus Brevis N 3 Bacillus brevis 1 Bacillus brevis 2 Bacillus brevis Na-K . 4 1 , 1974, 10 2 , 11 1971 11 , p4 L,D , 4,416 ? 4,314 4,4 16 12 13 - p6 L,D , 6,3 ? 4 1,4 ? p4 L,D N ? N N p6 L,D 25-30 ? 1 12 6 1974 10 , p Ї b 6-7 5,6 ? 7,2 1 1 p 4,416 f ? y p ? 14 . b b ? bb L D a L , b L D 2.3 10, 15, 16 4 16 10 1,2 ? 4 3 10 1 ? 2 10 . 1,2 ? 3 ? 205-240 4, 1,2 ? 3 3 10 1,2 ? 4 , 3 f ? y ? b ? a , b ? b , 18 4 . 1 ? 2 ? 5,6 2 17 . 4 1 , 1 ? 2 . 3 , 5,6 2 19 . 2 5,6 PDB Code 1ALX 28 10 6 , 20 , 18 DMSO 16 DMSO 21 22 23 , 2.4 24 13 19F 25-27 28 18 29, 30 31 32 1 10000 3 ? 33 34 15 2 35 13 19F N 25, 26, 27 36 N ? N ? N ? N 12 6 N 37 . 3 N 38 . 39 , 40 41 13 ? 15N ? 24 1985 6,3 b6,3 4 4 6,3 PDB Code 1GRM . A Trp 9Trp ? 15Trp ? 41 b6,3 o b6,3 41 5 5 ?6,3 5,6 ?7,2 42 17 90 , b6,3 12 . 2.5 43 44 , 45 , 46 , 47 , 48 49 39 ? 49 44 50 , 51 52 ?1 170 1 ?2 20 1 28 . 23Na 53 ? 4 1 7,2 b7,2 1,5 1Val ? 54 6 f ? y 31 26 4,9 17 6 7,2 7,2 PDB Code 1AV2 f ? y 55 6,4 , 7,2 17 . 2.6 56 . 7,2 40є f 11Trp ? 14Leu 10 57 55 58 59 60 17 . 2.7 43 61 ? 0,1 ? NaCl 5 pS 0,5 43 N ? N 17 100 5-10 N ? N , 32 N , N ? N ? 80 ? 62 63,64 N ? N 65 66 N ? N 2.8 33 ? 26 67 23 20 30 10 65 48 17 68 69 67 N- c N ? 17 . 28 70 ? 71 2.9 ? 90 72 , 73 41 41 N C 41 . 2.11 77 , 78 , 2.12 GABA 81 82 b6,3 G . 1. D Dubos R.J. 1940, Journal of Biological Chemistry v.132 p.2. Sarges R Witkop B 1964 Journal of American Chemical Society, vol.86, p.3. Sarges R Witkop B 1965 Journal of American Chemical Society, vol 87, p.4. Sarges R Witkop B 1965 Journal of American Chemical Society, vol 87, p.5. Sarges R Witkop B, 1965 Biochemistry, vol. 4, p.6. Weinshtein S Wallace B et.al 1980 Journal of Molecular Biology, vol 143, p7. Gross E Witkop B 1965 Biochemistry, vol. 4, p 8. Koeppe R.E. II, Paczkovski J.A Whaley W.L 1985 Biochemistry, vol. 24, p. 9. F Brazhnikova M.G 1944 Lancet, vol. 247, p. 10. T Boult E.R 1974 Biochemistry, vol. 13, p.11. Urry D.W 1971 Proc Natl Acad Sci U S A, vol.68, p12. N Chandrasekaran R, 1972 Ind. J. Biochem.

Biophys vol.9, p.13. Urry D.W 1971 Proc. Natl. Acad. Sci. U S A, vol 68, p.14. N Ramachandran G.N 1965 Biophys. J v.5, p15. Fossel E.T , Veatch W.R, Ovchinnikov Y.A Buolt E.R 1974 Biochemistry, vol.13, p16. Veatch W.R, Boult E. R 1974 Biochemistry, vol.13, p17. Wallace B.A 1990 Annu. Rev.Biophys.

Biophys Chem vol.19, p.18. F Arseniev A.S 1988. Tetrahedron, vol.44, p.19. Langs D.A 1988 Science, vol.241, p.188 20 1980 9, 21. E Lian L Y Randall E.W. 1987, Eur. J. Biochem vol.166, p. 22. E Rice-Evans C, et.al. 1972 FEBS Lett vol 25, p. 23. A Prasad K.U et.al. 1988 Biochemistry, vol.27, p.24. R Boult E.R. 1981 Biochemistry, vol. 20 p. 25. Weinstein S Durkin J.T et.al. 1985 Biochemistry, vol.24, p. 26. A Boult E.R, et.al 1979 Proc. Natl. Acad. Sci. U S A, vol. 76, p.27. Weinstein S Wallace B.A, et.al 1980 J. Mol.Biol vol.143, p.28. Wallace B.A. 1986 Biophys. J vol. 49, p.29. Kleinfeld A.M 1987 Curr. Top. Membr. Tansp vol.29, p.30. Scarlata S.F 1988 Biophys.J vol.54, p.31. Veatch W.R, Mathies R et.al. 1975 J.Mol.Biol vol.99, p.32. Veatch W.R, Styer L. 1977 J.Mol.Biol, vol.113, p.33. Masotti L Spisni A et.al. 1980 Cell Biopys vol.2, p.34. Bamberg E Lauger P 1977 J.Membr. Biol vol.35, p.351 35. Killian J.A de Kruijff B et.al. 1983 Biochim. Biophys.

Acta vol.78, p. 36. Cornell B Separovic F et.al. 1988 Biophys.J vol. 53, p. 37. Arseniev A. S Ovchinnikov Yu, A , Barsukov, I. L.Bystrov, V. F Lomize, A. L. 1985 FEBS Lett vol.186, p.38. T Andersen O. S et.al. 1986 Biophys.J vol.49, p.39. Szabo G Urry D. W. 1979 Proc. Natl. Acad. Sci. U S A, vol.68 p.40. J Urry D.W et.al. 1978 Science, vol.200, p.41. Koeppe R.E. Andersen O.S. 1996 Annu. Rev. Biophys.Biomol.

Struct vol. 25, p.231-42. Sychev, S. V.Barsukov, L. I.Ivanov, V. T. 1993 Eur Biophys J, vol.22, p. 279-88.The double pi pi 5.6 helix of gramicidin A predominates in unsaturated lipid membranes 43. B Haydon D.A 1972 Biochim. Biophys.

Acta vol.274, p.44. P Neher E. 1978 Biophys.J vol.22, p.45. S Koeppe R.E. 1984 Biophys.J vol.45, p. 263 46. Veatch W. R Durkin J.T. 1980 J.Mol.Biol vol.14, p.411 47. Hinton J.F Whaley W.L et.al. 1986 Biophys.J vol.50, p. 539 48. Dani. J.A Levitt D.G. 1981 Biophys.J vol.35, p.501 49. Hinton J.F Fernandez J.Q et.al. 1989 Biophys.J vol.55, p.327 50. Wallace B.A. 1983 Biopolymers, vol.22, p. 397 51. Hinton J.F Koeppe R.E. II, et.al. 1986 Biophys.J vol.49, p.571 52. Urry D.W Trapane T.L et.al. 1983 Science , vol.221, p.1064 53. Cornelis A Laszlo P 1989 Biochemistry, vol.18, p.2004 54. Arseniev A.S Barsukov I.L Bystrov V.F. 1985 FEBS Lett vol.180, p.33 55. Koeppe R.E.II, Berg J.M et.al. 1979 Nature, vol.279, p.723 56. Wallace B.A Ravikumar K. 1988 Science, vol.241, p.182 57. Sung S. S Jordan P. C. 198 Biophys.J vol.54, p. 519 58. Lee W.K Jordan P. C.1984 Biophys.J vol.46, p.805 59. Urry D.W Alonso-Romanovsky S et.al. 1984 J.Membr.Biol vol. 71, p.205 60. Trudelle Y Daumas P et.al. 1987 FEBS Lett vol.216, p.11 61. Barret Russel E.W Weiss L.B et.al. 1986 Biophys.J vol.49, p.673 62. Ovchinnikov Y.A Ivanov V.T. 1983 In Conformation in Biology, ed. R. Srinivasan, R.H. Sarma, p.155, New York Academic 63. Busath D.D Andersen O.S Koeppe R.E.II 1987 Biophys.J vol.51, p.79 64. Busath D.D Szabo G. 1981 Nature vol.294, p.371 65. Busath D.D Szabo G. 1988 Biophys.J vol.53, p.689 66. Andersen O.S Koeppe R.E et.al. 1987 In Transport through membranes, ed. K.Ygi, B.Pullman, p.295. Tokyo Academic 67. Wallace B.A. 1985 Biophys.J vol.45, p.114 68. LoGrasso P.V Moll F.III, Cross T.A 1988 Biophys.J vol.54, p.259 69. Killian J.A de Kruijff B 1985 Biochemistry vol.24, p.7881 70. Meulendijks G. Sonderkamp T et.al 1989 Biochim.

Biopphys.

Acta vol.979, p.321 71. Waalace B.A Veatch W.R Boult E.R. 1981 Biochemistry vol.20, p.5754 72. Durkin J. T Koeppe RE II, Andersen O.S. 1990 J.Mol.Biol. vol.211, p.221 73. Fonseca V Daumas P et.al. 1992 Biochemistry vol.31, p.5340 74. Mukherjee P.K. Paulus H. 1974 Proc. Natl. Acad. Sci USA, vol.74, no.2 75. .Sarcar.

N et al 1974 Proc. Natl. Acad. Sci USA, vol.74, no.4, pp.1478-1482, 76. Langs D.A. 1989 Biopolymers vol.28 1 , p.259 77. Killian J.A Taylor MJ, Koeppe DE II. 1992 Biochemistry vol.31, p.11283 78. Finkelstein A, Andersen OS. 1981. J.Membr. Biol. vol.59, p.155 79. Hodges RS, Merrifield RB, 1975 Anal. Biochem. vol.65, p.241 80. Paul BW, Ten Kortenaar, et.al. 1986 Int. J.Pep. Pro. Res vol.27, p.398 1 1974, 40-47, 174. 2. N.Sarcar et al Proc. Natl. Acad. Sci USA, vol.74, no.4, pp.1478-1482, 1974 3. P.K. Mukherjee H. Paulus Proc. Natl. Acad. Sci USA, vol.74, no.2 , 1974 4. Hladky Haydon , Nature, vol.255, pp. 451-453, 1970 5. W.R Veatch E.R. Boult, Biochemistry vol.13 no. 26, 1974, pp.5257-5261 6. D.W. Urry, Proc. Natl. Acad. Sci USA, vol.68 pp.672-676 7. Ramachandran Chandrasekaran, Ind. J. Biochem.

Biophys vol.9, pp1-11, 1972 8. E. Fossel, W. R. Veatch, Y. A. Ovchinnikov , E. Boult, Biochemistry vol.13 no. 26, 1974, pp 5264-5275 9 2, 581-593 1976 10. C 8, 1080-1088 1984 11. Ivanov V.T From structure towards the molecular mechanism of action , in Peptides 1982 12. D.W. Urry, in Spectroscopy of Biological Molecules , 487-510 13. Wallace B.A. Boult E.R. 1979 , Proc. Natl. Acad. Sci USA, vol.75, 1775-1779 14. Wallace B.A W.R. Veatch E.R.Boult 1981 , Biochemistry,20 5754-5760. 15 1980 9 121-151 16. Arseniev A.S Bystrov V.F V.T.Ivanov Yu.A. Ovchinnikov 1984 , FEBS Fed. Eur. Biochem.

Soc. Lett. 165 51-56. 17. Arseniev A.S Barsukov I.L Bystrov V.F A.L.Lomize Yu.A. Ovchinnikov 1985 , FEBS Fed. Eur. Biochem.

Soc. Lett.186 168-174. 18. Urry D.W J.T. Walker, T.L. Trapane 1980 , J. Membr. Biol. 69 225-231. 19. Arseniev A.S Barsukov I.L. Bystrov V.F 1985 FEBS Fed. Eur. Biochem . Soc. Lett. 180 33-39. 20. S.V.Sychev, S.V. Sukhanov, L.I. Barsukov V.T. Ivanov 1996 , J. Pep. Sci. 2 141-156. 21. N. Mobashery, C. Nielsen, O.S. Andersen 1997 , FEBS Fed. Eur. Biochem.

Soc. Lett. 412 15-20. 22. Cornell B.A M.A. Keniry 1983 , Biochim.

Biophys.

Acta. 732 705-710. 23. P. Daumas, D. Benamar other 1991 Int. J. Peptide Protein Res. 38 218-228. 24. Wallace B.A, 1986 , Biophys.

J. 49 295-306. 25. V. Krchnak, J. Vagner, P. Safar M. Lebl 1988 , Collection Czechoslovak Chem. Commun. 53 142-148. 26. K. U. Prasad, S. Alonso-Romanovski other, 1986 Biochemstry , 25 456-463 27. K. Bauer, R. Roskoski, H. Kleinkauf F. Lipmann 1972 Biochemistry, 11 3266-3270. 28. C.G Fields, G.B. Fields other, 1989 Int. J. Peptide Protein Res 33 298-303.