Во многих группах двусторонне-симметричных животных бластопор вытягивается и приобретает щелевидную форму. Такая форма бластопора характерна для кольчатых червей, моллюсков, круглых червей, членистоногих, низших хордовых и др. У членистоногих щелевидный бластопор представлен глубокой продольной бороздой, идущей по брюшной стороне зародыша и соединяющей зачатки рта и ануса. Замыкание щелевидного бластопора приводит к формированию трубчатого кишечника. В примитивных случаях бластопор сначала замыкается посредине, разделяясь на два отверстия, одно - на переднем, а другое - на заднем конце зародыша. Одно из этих отверстий соответствует рту, а другое - анусу.
Таким образом, данные эмбриологии помогли выяснить, во-первых, что брюшная сторона билатерально- симметричных животных представляет собой разрастание бластопоральной стороны, а во-вторых, что их рот и анус - производные переднего и заднего концов щелевидного бластопора.