рефераты конспекты курсовые дипломные лекции шпоры

Реферат Курсовая Конспект

ДНК-полимеразы археев

ДНК-полимеразы археев - раздел Биология, Эукариотические ДНК-полимеразы и ДНК-полимеразы археев   По Ультраструктуре Клеток Представители Третьего Домена Живых...

 

По ультраструктуре клеток представители третьего домена живых организмов археи (Archaea) похожи на бактерии и относятся к прокариотам. Их метаболические процессы в целом также похожи на бактериальные. Однако весь аппарат обработки генетической информации (транскрипции, трансляции и репликации ДНК) у археев гораздо ближе к аппарату эукариотов. У археев как РНК-полимеразы, так и ДНК-полимеразы напоминают эукариотические ферменты. Домен археев подразделяется на два субдомена: кренархеи (Crenarchaeota) и эуриархеи (Euryarchaeota). К первому классу относятся такие археи, как Sulfolobus, а ко второму – такие, как Pyrococcus. Наборы ДНК-полимераз у кренархеев и эуриархеев не одинаковы.

Оба субдомена археев имеют мономерные ДНК-полимеразы семейства В с мол. массой ~ 100 кД, похожие на эукариотические ДНК-полимеразы a, g и e.Они содержат в полимеразном активном центре типичные мотивы семейства В (YGDTDS и DxxSLIPS) и обладают (3’®5’)-экзонуклеазной активностью. У кренархеев имеются по меньшей мере две разные ДНК-полимеразы этого класса (PolBI и PolBII), а у эуриархеев – только одна ДНК-полимераза PolB, которая долгое время считалась их единственной ДНК-полимеразой. В дальнейшем оказалось, что наряду с PolB эуриархеи содержат вторую, гетеродимерную ДНК-полимеразу PolD, которая высокогомологична у различных эуриархеев, но не имеет гомологов у других организмов и выделена в новое семейство D.

ДНК-полимераза PolD состоит из большой каталитической субъединицы DP2 с мол. массой ~ 130-140 кД, обладающей (3’®5’)-экзонуклеазной активностью, и вспомогательной малой субъединицы DP1 с мол. массой ~ 70 кД, которая обладает слабой, но достоверной гомологией с субъединицей р66 ДНК-полимеразы d. Малая субъединица DP1 имеет древние «пирофосфатазные» мотивы, как у эубактериальных ДНК-полимераз III, и содержит типичный мотив связывания эукариотических факторов процессивности.

Все ДНК-полимеразы археев нуждаются для высокой процессивности в скользящем зажиме, который похож на эукариотический белок PCNA. Погрузку этого белка с мол. м. ~ 29 кД у археев вызывает комплекс RF-C, аналогичный эукариотическому, но состоящий не из пяти, а из двух разных субъединиц.

 

 

– Конец работы –

Эта тема принадлежит разделу:

Эукариотические ДНК-полимеразы и ДНК-полимеразы археев

На сайте allrefs.net читайте: Эукариотические ДНК-полимеразы и ДНК-полимеразы археев...

Если Вам нужно дополнительный материал на эту тему, или Вы не нашли то, что искали, рекомендуем воспользоваться поиском по нашей базе работ: ДНК-полимеразы археев

Что будем делать с полученным материалом:

Если этот материал оказался полезным ля Вас, Вы можете сохранить его на свою страничку в социальных сетях:

Все темы данного раздела:

Биосинтез ДНК. Общие определения
  ДНК, служащая первичным носителем генетической информации, является линейным или кольцевым гетерополимером, состоящим из 4 дезоксирибонуклеотидов (dA, dT, dG и dC), соединенных (3’®

A. ДНК дНТФ
    5’

ДНК-полимераза II E.coli
  ДНК-полимераза II (PolII), кодируемая геном polB (dinA), является единственной из ДНК-полимераз E. coli, относящимся к полимерзному семейству В, в которое входят преимуществе

ДНК-полимераза III E. coli
  Главной репликативной ДНК-полимеразой E. coli является многосубъединичный комплекс ДНК-полимеразы III (PolIII). Самая большая каталитическая a-субъединица PolIII длиной 1160

ДНК-полимераза a
Эукариотические ДНК-полимеразы a (Pola) входят в состав состоящего из 4 субъединиц белкового комплекса, в котором две самые большие субъединицы определяют ДНК-полимеразную активность, а две малые с

Главные эукариотические ДНК-полимеразы
  ДНК-поли- мераза (типсемейство) Функции Мол. массы субъединиц в кД Гены (хромосомы) Функции субъединиц

ДНК-полимераза b
  ДНК-полимераза b (Polb) млекопитающих является самой маленькой из известных эукариотических ДНК-полимераз и относится к семейству Х, к которому принадлежит, например, и терминальная

ДНК-полимераза g
ДНК-полимераза g (Polg), кодируемая ядерными генами, является единственной эукариотической ДНК-полимеразой, участвующей в репликации митохондриальной ДНК (мтДНК), которая идет по непрерывному механ

ДНК-полимеразы d и e
Гетеромультимерные ДНК-полимеразы g и e (Polg и Pole) участвуют не только в репликации ДНК, но и в нуклеотидной эксцизионной репарации, эксцизионной репарации оснований, коррекции ошибочно спаренны

Скользящие зажимы ДНК-полимераз и их погрузчики
  1.4.1. Скользящие зажимы – факторы процессивности ДНК-полимераз   Особый класс субъединиц холоферментов ДНК-полимераз образуют белки-зажим

Погрузчики скользящего зажима
  Кольца олигомерных форм белков DnaN и PCNA являются очень стабильными. Так, константа диссоциации димера DnaB не превышает 50 нМ, а период «полураспада» димерного кольца, надетого н

Общая характеристика геликаз
Геликазами называются ферменты, способные расплетать две комплементарные нити дуплексов нуклеиновых кислот с использованием энергии, полученной при гидролизе 5’-НТФ. Геликазы могут расплетат

Свойства репликативной ДНК-геликазы DnaB E. coli
  ДНК-геликаза DnaB имеет длину 471 аминокислотный остаток (мол. масса 52,4 кД) и кодируется геном dnaB (92-ая мин генетической карты). Количество молекул белка DnaB на клетку

ДНК-геликаза репликативной вилки у эукариотов
  Общее число различных ДНК-геликаз даже у низших эукариотов гораздо больше чем у бактерий. Так, в геноме дрожжей S. cerevisiae около 200 открытых рамок считывания кодируют пре

Механизм действия гексамерных ДНК-геликаз
Рассмотрим рабочие модели нескольких последовательных этапов в каталитическом цикле репликативных гексамерных ДНК-геликаз. Эти модели основаны на экспериментальных данных, но во многих деталях оста

N I II C
Рис. 2.8. Схема организации белка DnaC E. coli. I – область взаимодействия с белком DnaB, II – мотивы связывания АТФ   Количество белка DnaС на клетк

Белки, связывающие однонитевую ДНК
  Однонитевые участки ДНК, появляющиеся в процессах репликации, репарации и рекомбинации ДНК, могут быстро превращаться в нуклеопротеиновые комплексы, полностью покрываясь специальным

Праймазы
  Синтез затравок РНК в процессе образования фрагментов Оказаки при репликации ДНК (преимущественно в отстающей нити) катализируется праймазами – особой разновидностью ДНК-зави

RNAP Toprim
Рис. 2.18. Доменная организация праймазы DnaG E. coli. I – домен связывания с ДНК, II – центральный каталитический домен, III - линкерный домен, IV – домен взаимодействия с другими

ДНК-лигазы
  ДНК-лигазы катализируют образование фосфодиэфирной связи в однонитевом разрыве (ОР) днДНК между смежными 3’-гидроксильным и 5’-фосфатным концами разорванной нити. Для связыва

Свойства и функции ДНК-топоизмераз
Организм Фермент Ген Поло-жение гена* Длина белка (а.о.) Субъеди-ничная структура Подсе-мейство

Белок-инициатор DnaA
  Белок DnaA играет ключевую роль в инициации репликации хромосомы у многих бактерий. Он последовательно выполняет 3 главные функции: 1) узнает область начала репликации oriC, последо

Минимальная область начала репликации oriC y E.coli
  Область начала репликации (ОНР) oriC является уникальным местом инициации нормальной двунаправленной репликации хромосомы E. coli и расположена на 84-ой мин генетической карт

IHF R5(M)
         

Этапы инициации репликации на ОНР oriC
  Для инициации репликации в ОНР oriC необходимо, чтобы матрица ДНК находилась в сверхскрученной кольцевой форме. Первой стадией инициации является образование начального “преиницииру

Регуляция инициации репликации хромосомы E. coli
  Контроль инициации репликации хромосомы в области oriC имеет два аспекта. Прежде всего, репликация инициируется в фиксированный момент клеточного цикла, через интервалы, равные врем

Области начала репликации (ОНР) ARS и комплекс узнавания ОНР (ORC)
У S. cerevisiae были идентифицированы специфические элементы хромосомной ДНК, названные автономно реплицирующимися последовательностями ARS (autonomously replicating sequences). Встраивание

Этапы пути инициации репликации на ОНР у дрожжей
В конце митоза или в начале фазы G1 клеточного цикла нуклеопротеиновые комплексы ORC-ARS вербуют на ДНК белок Cdc6 c мол. массой 58 кД. Этот белок очень нестабилен и должен синтезировать

Инициация репликации у высших эукариотов
  3.3.1. Белковые компоненты и путь инициации репликации   Гомологи большинства белков S. cerevisiae, участвующих в описанном выше пу

А. В. С.
Рис. 3.10. Электрофоретические картины радиоавтографов рестрикционных фрагментов реплициру

Регуляция инициации репликации в эукариотических клетках
  В эукариотических клетках существует главный регуляторный механизм, делающий инициацию репликации на каждой ОНР возможной один и только один раз за клеточный цикл. Он назван лице

Хотите получать на электронную почту самые свежие новости?
Education Insider Sample
Подпишитесь на Нашу рассылку
Наша политика приватности обеспечивает 100% безопасность и анонимность Ваших E-Mail
Реклама
Соответствующий теме материал
  • Похожее
  • Популярное
  • Облако тегов
  • Здесь
  • Временно
  • Пусто
Теги