рефераты конспекты курсовые дипломные лекции шпоры

Реферат Курсовая Конспект

Этапы пути инициации репликации на ОНР у дрожжей

Этапы пути инициации репликации на ОНР у дрожжей - раздел Биология, Эукариотические ДНК-полимеразы и ДНК-полимеразы археев В Конце Митоза Или В Начале Фазы G1 Клеточного Цикла Нуклеопротеин...

В конце митоза или в начале фазы G1 клеточного цикла нуклеопротеиновые комплексы ORC-ARS вербуют на ДНК белок Cdc6 c мол. массой 58 кД. Этот белок очень нестабилен и должен синтезироваться de novo после выхода клеток из митоза. Он имеет несколько доменов гомологии с субъединицами Orc1, Orc4 и Orc5 комплекса ORC и взаимодействует с ним. Кроме того, Cdc6 гомологичен белкам g-комплекса бактериальной ДНК-полимеразы III и эукариотического комплекса RFC – многосубъединичным ферментам, катализирующим зависящую от гидролиза АТФ погрузку на ДНК скользящих зажимов ДНК-полимераз. Подобно этим ферментам класса АТФаз ААА+, белок Cdc6 способен связывать и медленно гидролизовать АТФ in vitro. Консервативный домен связывания нуклеотидов в Cdc6 необходим для функционального взаимодействия с ORC-ARS in vivo. По аналогии с погрузчиками факторов процессивности, считается, что Cdc6 является погрузчиком на хроматин кольцевого комплекса MCM – ДНК-геликазы репликативных вилок, концентрация которой в клетках дрожжей в 10-100 раз больше концентрации ORC. Белок Cdc6 преимущественно взаимодействует в ORC с комплексом Orc1-АТФ. После узнавания ORC белком Cdc6, связавшим АТФ, образуется комплекс ARS-ORC-Cdc6, который, используя катализируемый Cdc6 гидролиз АТФ, привлекает к ОНР белки Mcm2-Mcm7. В этом процессе у S. cerevisiae участвует также не гомологичный субъединицам гексамера МСМ белок Mcm10, взаимодействующий с Mcm7. Отметим также, что связанный с ORC белок Cdc6 cпособствует ассоциации фактора транскрипции Abf1 c элементом В3 в ARS.

Погрузка геликазы МСМ на ORC-ARS в начале фазы G1 завершает образование “предрепликативного комплекса”, в котором ОНР получила “лицензию на репликацию” и перешла в компенентное для инициации состояние. Однако “запуск” (firing) репликации на уже готовой к инициации ОНР откладывается до фазы S клеточного цикла. Для такого запуска необходимо действие циклин-зависимых протеинкиназ, которые появляются только в начале этой фазы. К ним относятся комплексы главной киназы Cdc28 c циклинами типа В (Clb5 и Clb6) и киназы Cdc7 c её регуляторным циклиноподобным белком Dbf4. Циклины Clb5 и Clb6 синтезируются уже в фазе G1 и ассоциируются с Cdc28, но эти комплексы остаются неактивными до начала фазы S, когда их ингибитор Sic1 фосфорилируется под действием комплексов Cdc28 с циклинами фазы G1 и подвергается зависящему от убиквитина протеолизу. Белок Dbf4 очень нестабилен в течение всего клеточного цикла, особенно в начале фазы G1, когда его период полураспада равен 5 мин. Однако в начале фазы S его уровень и активность протеинкиназы Cdc7-Dbf4 достигают максимума. Таким образом, оба типа протеинкиназ становятся активными почти одновременно. Однако в активации ими ОНР проявляется определенная иерархия: Cdc7-Dbf4 действует после Cdc28-Clb.

Одним из субстратов для Cdc28-Clb является белок Cdc6, который сыграл свою роль после погрузки комплекса МСМ. Этот белок после фосфорилирования покидает комплекс с ORC и подвергается протеолитической деградации. В освобождении связанного Cdc6 может играть роль гидролиз АТФ, связанного с белком Orc1. На освободившееся место вербуется новый важный компонент инициации репликации – белок Cdc45, который взаимодействует с белками МСМ. Для включения Cdc45 в предрепликативный комплекс требуется действие киназы Cdc7-Dbf4, которая связывается с белками МСМ и вызывает их фосфорилирование. Белки Mcm2-4 и Mcm6-7 являются субстратами для этой киназы in vitro. Фосфорилирование МСМ под действием Cdc7-Dbf4 сопровождается повышением чувствительности ДНК в области В2 ARS1 к KMnO4, взаимодействующему с онДНК. Это показало, что Cdc7-Dbf4 запускает переход ДНК геликазы МСМ в активное состояние (см. 2.1) и вызывает локальное расплетание ДНК в богатом А:Т сегменте ОНР. Связывание Cdc45 и модификация MCM приводят к образованию “преинициирующего комплекса”. В этот комплекс привлекаются также связывающий онДНК белок RPA и ДНК-полимераза a - праймаза. Вербовка этих белков критически зависит от присутствия в преинициирующем комплексе белка Cdc45, который может физически взаимодействовать с ними. В частности, белок Cdc45 связывается с субъединицей р70 комплекса Pola-праймаза (рис. 00). Киназа Cdc7-Dbf4 способна фосфорилировать и такие компоненты репликативного комплекса, как ДНК-полимераза a. Вербовка Pola-праймазы является первым этапом образования репликативных вилок на ARS.

 

 

– Конец работы –

Эта тема принадлежит разделу:

Эукариотические ДНК-полимеразы и ДНК-полимеразы археев

На сайте allrefs.net читайте: Эукариотические ДНК-полимеразы и ДНК-полимеразы археев...

Если Вам нужно дополнительный материал на эту тему, или Вы не нашли то, что искали, рекомендуем воспользоваться поиском по нашей базе работ: Этапы пути инициации репликации на ОНР у дрожжей

Что будем делать с полученным материалом:

Если этот материал оказался полезным ля Вас, Вы можете сохранить его на свою страничку в социальных сетях:

Все темы данного раздела:

Биосинтез ДНК. Общие определения
  ДНК, служащая первичным носителем генетической информации, является линейным или кольцевым гетерополимером, состоящим из 4 дезоксирибонуклеотидов (dA, dT, dG и dC), соединенных (3’®

A. ДНК дНТФ
    5’

ДНК-полимераза II E.coli
  ДНК-полимераза II (PolII), кодируемая геном polB (dinA), является единственной из ДНК-полимераз E. coli, относящимся к полимерзному семейству В, в которое входят преимуществе

ДНК-полимераза III E. coli
  Главной репликативной ДНК-полимеразой E. coli является многосубъединичный комплекс ДНК-полимеразы III (PolIII). Самая большая каталитическая a-субъединица PolIII длиной 1160

ДНК-полимераза a
Эукариотические ДНК-полимеразы a (Pola) входят в состав состоящего из 4 субъединиц белкового комплекса, в котором две самые большие субъединицы определяют ДНК-полимеразную активность, а две малые с

Главные эукариотические ДНК-полимеразы
  ДНК-поли- мераза (типсемейство) Функции Мол. массы субъединиц в кД Гены (хромосомы) Функции субъединиц

ДНК-полимераза b
  ДНК-полимераза b (Polb) млекопитающих является самой маленькой из известных эукариотических ДНК-полимераз и относится к семейству Х, к которому принадлежит, например, и терминальная

ДНК-полимераза g
ДНК-полимераза g (Polg), кодируемая ядерными генами, является единственной эукариотической ДНК-полимеразой, участвующей в репликации митохондриальной ДНК (мтДНК), которая идет по непрерывному механ

ДНК-полимеразы d и e
Гетеромультимерные ДНК-полимеразы g и e (Polg и Pole) участвуют не только в репликации ДНК, но и в нуклеотидной эксцизионной репарации, эксцизионной репарации оснований, коррекции ошибочно спаренны

ДНК-полимеразы археев
  По ультраструктуре клеток представители третьего домена живых организмов археи (Archaea) похожи на бактерии и относятся к прокариотам. Их метаболические процессы в целом такж

Скользящие зажимы ДНК-полимераз и их погрузчики
  1.4.1. Скользящие зажимы – факторы процессивности ДНК-полимераз   Особый класс субъединиц холоферментов ДНК-полимераз образуют белки-зажим

Погрузчики скользящего зажима
  Кольца олигомерных форм белков DnaN и PCNA являются очень стабильными. Так, константа диссоциации димера DnaB не превышает 50 нМ, а период «полураспада» димерного кольца, надетого н

Общая характеристика геликаз
Геликазами называются ферменты, способные расплетать две комплементарные нити дуплексов нуклеиновых кислот с использованием энергии, полученной при гидролизе 5’-НТФ. Геликазы могут расплетат

Свойства репликативной ДНК-геликазы DnaB E. coli
  ДНК-геликаза DnaB имеет длину 471 аминокислотный остаток (мол. масса 52,4 кД) и кодируется геном dnaB (92-ая мин генетической карты). Количество молекул белка DnaB на клетку

ДНК-геликаза репликативной вилки у эукариотов
  Общее число различных ДНК-геликаз даже у низших эукариотов гораздо больше чем у бактерий. Так, в геноме дрожжей S. cerevisiae около 200 открытых рамок считывания кодируют пре

Механизм действия гексамерных ДНК-геликаз
Рассмотрим рабочие модели нескольких последовательных этапов в каталитическом цикле репликативных гексамерных ДНК-геликаз. Эти модели основаны на экспериментальных данных, но во многих деталях оста

N I II C
Рис. 2.8. Схема организации белка DnaC E. coli. I – область взаимодействия с белком DnaB, II – мотивы связывания АТФ   Количество белка DnaС на клетк

Белки, связывающие однонитевую ДНК
  Однонитевые участки ДНК, появляющиеся в процессах репликации, репарации и рекомбинации ДНК, могут быстро превращаться в нуклеопротеиновые комплексы, полностью покрываясь специальным

Праймазы
  Синтез затравок РНК в процессе образования фрагментов Оказаки при репликации ДНК (преимущественно в отстающей нити) катализируется праймазами – особой разновидностью ДНК-зави

RNAP Toprim
Рис. 2.18. Доменная организация праймазы DnaG E. coli. I – домен связывания с ДНК, II – центральный каталитический домен, III - линкерный домен, IV – домен взаимодействия с другими

ДНК-лигазы
  ДНК-лигазы катализируют образование фосфодиэфирной связи в однонитевом разрыве (ОР) днДНК между смежными 3’-гидроксильным и 5’-фосфатным концами разорванной нити. Для связыва

Свойства и функции ДНК-топоизмераз
Организм Фермент Ген Поло-жение гена* Длина белка (а.о.) Субъеди-ничная структура Подсе-мейство

Белок-инициатор DnaA
  Белок DnaA играет ключевую роль в инициации репликации хромосомы у многих бактерий. Он последовательно выполняет 3 главные функции: 1) узнает область начала репликации oriC, последо

Минимальная область начала репликации oriC y E.coli
  Область начала репликации (ОНР) oriC является уникальным местом инициации нормальной двунаправленной репликации хромосомы E. coli и расположена на 84-ой мин генетической карт

IHF R5(M)
         

Этапы инициации репликации на ОНР oriC
  Для инициации репликации в ОНР oriC необходимо, чтобы матрица ДНК находилась в сверхскрученной кольцевой форме. Первой стадией инициации является образование начального “преиницииру

Регуляция инициации репликации хромосомы E. coli
  Контроль инициации репликации хромосомы в области oriC имеет два аспекта. Прежде всего, репликация инициируется в фиксированный момент клеточного цикла, через интервалы, равные врем

Области начала репликации (ОНР) ARS и комплекс узнавания ОНР (ORC)
У S. cerevisiae были идентифицированы специфические элементы хромосомной ДНК, названные автономно реплицирующимися последовательностями ARS (autonomously replicating sequences). Встраивание

Инициация репликации у высших эукариотов
  3.3.1. Белковые компоненты и путь инициации репликации   Гомологи большинства белков S. cerevisiae, участвующих в описанном выше пу

А. В. С.
Рис. 3.10. Электрофоретические картины радиоавтографов рестрикционных фрагментов реплициру

Регуляция инициации репликации в эукариотических клетках
  В эукариотических клетках существует главный регуляторный механизм, делающий инициацию репликации на каждой ОНР возможной один и только один раз за клеточный цикл. Он назван лице

Хотите получать на электронную почту самые свежие новости?
Education Insider Sample
Подпишитесь на Нашу рассылку
Наша политика приватности обеспечивает 100% безопасность и анонимность Ваших E-Mail
Реклама
Соответствующий теме материал
  • Похожее
  • Популярное
  • Облако тегов
  • Здесь
  • Временно
  • Пусто
Теги