рефераты конспекты курсовые дипломные лекции шпоры

Реферат Курсовая Конспект

Мутант имеет лентовидный лист, на котором формируются почки, рецессивная мутация, получена на расе Blanes К-6

Мутант имеет лентовидный лист, на котором формируются почки, рецессивная мутация, получена на расе Blanes К-6 - раздел Биология, Позиционное Выделение Нового Гена Taeniata In Silico...

ПОЗИЦИОННОЕ ВЫДЕЛЕНИЕ НОВОГО ГЕНА TAENIATA IN SILICO

Мутант имеет лентовидный лист, на котором формируются почки, рецессивная мутация, получена на расе Blanes (К-6)

Дт

Рецессивная мутация, на узких листьях появляются лопасти и новые побеги.

Задание 1. Сформулируйте гипотезу о функции гена. Назовите мутант в соответствие с правилами номенклатуры. Поищите мутанты сходного фенотипа в банках и запланируйте тест на аллелизм. Как вы его будете осуществлять?

Функция-негативный регулятор пролиферации клеток меристемы листа.

Мутант tae- (или tll- (Taenia-like leaf))

В банках схожий фенотип у мутантов bop2, as1

Тест на аллелизм : tae- tae-Х bop2- bop2-

Если все растения F1 от скрещивания имеют дикий(нормальный) фенотип, то мы имеем мутации в разных генах. Полученную гетерозиготу можно скрестить с одним из исходных мутантов. При выщеплении дикого типа делаем вывод о том, что это разные гены. Если анализировать поколение от скрещивания гетерозигот дикого типа, то при расщеплении 10:6 будем иметь межаллельную комплиментацию, а значит, один ген.

Задание 2. К сожалению, у Вас нет никаких данных о хромосоме, где находится Ваш ген. Поэтому Вы начинаете сразу работать с ДНК-маркерами ко всем 5 хромосомам арабидопсис. На первом этапе Вы ищите те ДНК-маркеры, которые будут информативны. Перед Вами результаты электрофереза продуктов рестрикции с одним из ДНК-маркеров для рас Dijon (К1), Columbia (К8), линии Ler, расы Enkheim (K2), Blanes (K6) и рядом маркерных линий (К310б mm1R, mmiL). Какие расы/линии следует использовать в скрещивании с Вашим мутантом.

Аналогичный анализ сделан и по другим маркерам. Картина разная. Что делать? С чем скрещивать?

 

Полиморфизм имеем между нашей расой Blanes и Columbia (К8), К310. Для этого маркера проводим скрещивание наших мутантов и одной из полиморфных линий, из анализа гибридов делаем выводы о степени сцепления гена и маркера. Для других маркеров подобная логика.

Задание 3. Опишите последовательные этапы работы по молекулярно-генетическому картированию (начиная, от выбора родительских рас для скрещиваний). Не забудьте посчитать выборку, работая с которой Вы сможете найти рекомбинантов между вашим геном и маркером, который тесно сцеплен с ним (1сМ, 0.5сМ, 0.2сМ, 0.1сМ) и указать, с из каких фенотипических классов растений Вы будете выделять ДНК.

 

Расы для скрещивания с нашим мутантом должны иметь полиморфизм по маркерам. Для начала следует определить группу сцепления признака, для чего используем маркеры к разным хромосомам. Далее определяем расположение на хромосоме, грубое картирование с использованием маркеров, расположенных равномерно на большом расстоянии друг от друга. После определения примерного расположения локуса, проводим тонкое картирование. Для этого используем молекулярные маркеры, расположенные в ранее определенном участке хромосомы на небольшом расстоянии друг от друга (4-6сМ).

 

КРОС R Q n
0,01 0,00495 0,99505 603,6993
0,005 0,002488 0,997513 1202,816
0,002 0,000998 0,999002 3000,238
0,001 0,0005 0,999501 5995,964

 

ДНК выделяем из организмов F2 с фенотипом tae-.

Задание 4. В таблице результаты анализа полиморфизма ДНК по 5 ДНК-маркерам к разным хромосомам. ДНК выделяли из мутантов из F2. Есть ли сцепление? С какой хромосомой?

Результаты анализа расщепления в поколении F2

Маркер Хромосома Число рекомбинантных растений Число нерекомбинантных растений Число рекомбинантных и нерек. хромосом Частота рекомбинаций (%)
PT14   primer1:GATCGATCGATAAAAAGCAAGGTCC primer2:TGGTTCGTCTCTTGACAAATC 6 гетерозигот, 2 гомозиготы Рек=10 Нерек=14 0.4
T20D163 2 гетерозиготы и 1 гомозигота Рек=4 Нерек=24 0.14
TSA1 6 гетерозигот и 4 гомозиготы Рек=14 Нерек=10 0.58
ATMYB3R 8 гетерозигот и 2 гомозиготы Рек=12 Нерек=12 0.5
AT5G06720 6 гетерозигот и 3 гомозиготы Рек=12 Нерек=12 0.5

 

Сцепление со 2 хромосомой

 

Задание 5. Пользуясь базой TAIR, определите где локализованы эти ДНК-маркеры, созданные к разным генам для картирования гена TAE. Напишите названия генов и их положение на RI-карте. Укажите размер ПЦР-продукта

Праймеры, использованные для картирования

Ген и его локализа-ция Размер ПЦР-продукта Последовательность нуклеотидов
2 хромосома AT2G31751.1 13499341…13502114 bp Между ASP1 и SGCSNP210, т.е между 62.78 63.18 сМ 63,13…63,13сМ примерно   праймер 1: AACAAAGAAGCTTCCAAGC праймер 2: ATACTTATGCTGACCGAGTCG
AT2G34710.1 (ATHB14, PHABULOSA, PHABULOSA 1D, PHB, PHB-1D) 14639323…14644273 bp Между VE016 и M323. 67.66 и 67.97. 67,70070068…67,70723939сМ     праймер 1: AGTTGCGCGAAATAGCGACTA   праймер 2: ATGATGGTCCATTCGATGAGC
AT2G34650.1 (ABR, ABRUPTUS, PID, PINOID) 62.00-62.00       праймер 1: TATTGCTCCGGTGGTGATGTA праймер 2: TAAGAACAGGTCTGTTCTTGCAG
AT2G38120.1 ( ATAUX1, AUX1, AUXIN RESISTANT 1, MAP1, MODIFIER OF ARF7/NPH4 PHENOTYPES 1, PIR1, WAV5, WAVY ROOTS 5) 15972993…15977180bp Между LTP и VE018,72.27 и 69.73. 71,495…71,506сМ   праймер 1: TTCACGCTAACGATTCCGTCA праймер 2: ATTCAACACGTACATCGCCG
AT2G41370.1 (ВОР2) 17237744…17240440bp GLU2 и ATGST6 94.03 cM и87.48cM 93,85сМ   праймер 1: GATGCATGTCTTGCTTTCTTGA праймер 2: GAGCAATCTTGAAGAATCTTTGAG

 

Если положение маркера на RI-карте не определено, попробуйте определить его примерно на основании информации о положении на генетической и физической картах ДНК-маркеров, фланкирующих выбранный. Как Вы будете определять положение Вашего маркера на RI-карте – опишите логику.

 

Ищем маркеры, фланкирующие интересующий нас локус, расположение которого известно и на физической, и на генетической картах. Пересчитываем размер в парах оснований для данного участка в сМ, из чего находим предполагаемое положение нашего локуса на генетической карте.

 

Нарисуйте совмещенную карту интересующего участка с указанием всех параметров

Задание 6.

Для выделения ДНК использовали растения F2 поколении, гомозиготные по исследуемой мутации. Перед Вами результаты анализа (таблица). Рассчитайте расстояние до маркера. Поправку Касамби использовали? Заполните пустующие ячейки в таблице.

Результат молекулярного картирования гена TAE

Маркер MSU-T20D163 MSU-COP1 63.34-63.34 cM 13977933 - 13983535 bp MSU-PHB 14639323 - 14644273 bp MSU-PID 62.0-62.0 cM 14589760 - 14591788 bp MSU-AUX1 66.0-66.0 cM 15972993 - 15977180 bp MSU-BOP2 17237745 - 17240440 bp
Положение на классической карте,сМ 60.0 62.0 66.0 94,17
Растений, несущих маркер Dijon
Растений, несущих маркер Blanes
Растений, несущих маркер Dijon и Blanes
Проанализировано хромосом
Рекомбинантных хромосом
Расстояние по классической карте,сМ 17,8 2,8 1,85 1,85 3,77 4,76
  18,68          

 

Поправку Касамби использовали для маркера T20D163, т.к рассчитанное расстояние больше 10сМ

   

Phenotypes

   

– Конец работы –

Используемые теги: Мутант, имеет, лентовидный, Лист, котором, формируются, почки, рецессивная, мутация, получена, расе, Blanes, К-60.127

Если Вам нужно дополнительный материал на эту тему, или Вы не нашли то, что искали, рекомендуем воспользоваться поиском по нашей базе работ: Мутант имеет лентовидный лист, на котором формируются почки, рецессивная мутация, получена на расе Blanes К-6

Что будем делать с полученным материалом:

Если этот материал оказался полезным для Вас, Вы можете сохранить его на свою страничку в социальных сетях:

Еще рефераты, курсовые, дипломные работы на эту тему:

Люди, которые смеются, и люди, над которыми смеются
Между тем комизм определяется не тем и не другим в отдельности, а воздействием объективных данных на человека. О важности психологического фактора не раз писалось в эстетиках. Конечно,… В мире должно быть место юмору, поэтому надо понять его механизм и функции, но не забывая при этом, что серьезным…

Способы получения сложных эфиров. Конденсации формальдегида с изобутиленом. Различные способы получения фенола
Данный метод имеет промышленное значение. 3. Присоединение органических кислот к алкенам: 4. Синтез сложных эфиров путем дегидрогенизации спиртов:… Этерификацию спиртов карбоновыми кислотами можно проводить в отсутствии… В присутствии кислотных катализаторов этерификация протекает при температуре 70-150ОС. Наиболее распространенными…

Порядок получения лицензии. Требования к пакету документов, необходимых для получения лицензии
Само понятие туристская деятельность подразумевает под собой туроператорскую и турагентскую деятельность, а также иную деятельность по организации… Соискателями туристской лицензии могут быть российские юридические лица или… Лицензирование туристской деятельности осуществляется Федеральным агентством по туризму, которое в течение 45 дней с…

Фишер Марк. ГЛАВА 1, в которой молодой человек приходит за советом к богатому родственнику ЖИЛ да был однажды талантливый молодой человек, которому ужасно
В ТОТ ЖЕ день наш герой отправился в городок где проживал Моментальный Миллионер Интересно думал он в дороге согласится ли миллионер принять... ГЛАВА в которой молодой человек учится рисковать и пользоваться... Ну вот а теперь скажите сколько вы хотели бы заплатить за секрет богатства Вопрос Моментального Миллионера застал...

Есть только одна раса — раса человечества, Есть только один язык — язык сердца, Есть только одна религия — религия любви
Мое отношение к религии или Что я вижу в мире Бога... Есть только одна раса раса человечества Есть только один язык язык... Есть только один Бог и Он вездесущ...

Мембранные органоиды – органоиды, которые имеют в своём составе биологическую мембрану
Мембранные органоиды органоиды которые имеют в сво м составе биологическую мембрану... Мембранные органоиды... v Эндоплазматическая сеть...

ОПИСАНИЕ ТЕХНОЛОГИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА И СХЕМЫ ПОЛУЧЕНИЯ АММИАКА
Сероочистка узел снижения давления природного газа ГП на входе в агрегат и схема топливного... Схема топливного газа... Схема...

Инглиизм 6 курс 3 – конспект выполнил Dimans, чуточку изменила РАСА. Оригинальные рисунки от Dimansасмотрите в его конспекте на Анаслав.ру
СОДЕРЖАНИЕ Поэтому данную систему наши Предки взяли за основу для построения... Начало урока...

Религиоведение 2 курс 2 - конспект выполнила РАСА
СОДЕРЖАНИЕ А матрице Девы Марии В некоторых апокрифических источника что и... Они натравили сотни миллионов были уничтожены и там один два миллиона на всю Европу осталось и уже начали писать...

Религиоведение 3 курс 2 - конспект выполнила РАСА
СОДЕРЖАНИЕ Христианство это учение не самого Христа а учение Саула т е... Иисус говорит об Отце из высшего мира иудеи говорят об отце из нижнего мира А это совершенно разные системы А...

0.026
Хотите получать на электронную почту самые свежие новости?
Education Insider Sample
Подпишитесь на Нашу рассылку
Наша политика приватности обеспечивает 100% безопасность и анонимность Ваших E-Mail
Реклама
Соответствующий теме материал
  • Похожее
  • По категориям
  • По работам