Пространственная (стереоизомерия)

Пространственная изомерия обусловлена различным пространственным расположением атомов при одинаковом порядке их связывания.

Различают:

1) геометричекую (цис-, транс-изомерию)

Наиболее устойчивы транс-изомеры, поэтому в природе они наиболее распространены.

Цис-форма — 2 заместителя расположены по одну сторону плоскости двойной связи.

Транс-форма – 2 заместителя расположены по разные стороны плоскости двойной связи.

2) Оптическая изомерия

Для описания пространственных различий используют два важнейших понятия: конфигурация и конформация молекул.

Конфигурация –определенное пространственное расположение атомов в молекуле, без учета различий, возникающих вследствие вращения вокруг одинарных связей.

В основе пространственного строения лежит предположение Вант-Гоффа (1874 г) о тетраэдрической конфигурации атома углерода, которое впоследствии было полностью подтверждено. Если у атома углерода все четыре заместителя одинаковые, то пространственная модель - тетраэдр, валентный угол – 109,5⁰. Если заместители разные, то угол несколько отличается от нормального. На плоскости обычно изображают атом углерода и две связи. Связь, направленную к наблюдателю показывают жирной чертой, от наблюдателя за плоскостью — пунктирной или заштрихованной линией.

Термин конформациябыл предложен в 1929 году Хеуорсом,

Конформации молекулы представляют собой различные ее геометрические формы, возникающие в результате вращения вокруг одинарных связей. Оперировать бесчисленным множеством конформаций практически невозможно, поэтому принимают во внимание молекулярные структуры, в которых последовательно осуществлен поворот вокруг простой связи на 60⁰ , При полном обороте вокруг центральной связи возникает 6 конформаций.

7. Оптическая изомерия; хиральность молекул органических соединений. Энантиомеры и диастереомеры. Связь пространственного строения с физиологической активностью органических соединений.

Энантиомеры — пара стереоизомеров, представляющих собой зеркальные отражения друг друга, не совмещаемые в пространстве. Простейший пример такой молекулы — это атом углерода с четырьмя разными заместителями. К примеру, СHClBrF или аланин CH₃CHNH₂COOH (рис. 1). Наличие у такой молекулы двух разных конфигураций связано с тем, что у атома углерода, образующего четыре одинарные связи, эти связи направлены к вершинам тетраэдра.

Рис. 1. Аминокислота аланин CH3CHNH2COOH. Две молекулы, состоящие из атома углерода с четырьмя разными заместителями, — оптические изомеры. Живые существа используют только левовращающие изомеры аминокислот (на рисунке справа)

Диастереомеры — стереоизомеры, не являющиеся зеркальными отражениями друг друга Диастереомерия возникает, когда соединение имеет несколько стереоцентров. Если два стереоизомера имеют противоположные конфигурации всех соответствующих стереоцентров, то они являются энантиомерами. Однако, если конфигурация различается лишь у некоторых (а не у всех) стереоцентров, то такие стереизомеры являются диастереомерами. Если диастереомеры отличаются конфигурацией лишь одного стереоцентра, то они называются эпимерами.

Атом углерода с четырьмя разными заместителями называется хиральным атомом (от греческого heiros «ладонь» — тот же корень, что и в слове «хиромантия»). Чем больше хиральных атомов в молекуле, тем больше у вещества может быть оптических изомеров. Интересно, что возможны органические вещества, которые имеют оптические изомеры, хотя в них формально нет ни одного хирального атома — центра изомерии.

Биологическая активность зависит от оптического строения. Некоторые ферменты могут взаимодействовать только с одним изомером одного вещества (абсолютная специфичность) либо с определенным изомером веществ гомологического ряда (стереоспецифичность)

8. Типы реакций в биоорганической химии: S_R, S_E, S_N, A_E, A_N, E. Примеры

В настоящее время приняты три типа классификаций химических реакций.

1. По направлению реакции.

Этот тип делится на две большие группы. К первой группе относят реакции, протекающие без изменения структуры углеродного скелета (порядок соединения атомов углерода в молекуле продукта реакции аналогичен порядку соединения атомов углерода в исходном веществе). Ко

второй группе относят реакции, протекающие с изменением структуры углеродного скелета (порядок соединения атомов углерода в продукте реакции отличается от порядка соединения атомов углерода в исходном веществе). Первую группу реакций (I) составляют реакции замещения (S), присоединения (А), элиминирования или отщепления (Е), некоторые реакции перегруппировки и изомеризации. Вторую группу реакций (II) составляют реакции удлинения углеродной цепи, укорочения углеродной цепи, некоторые реакции изомеризации и перегруппировки, циклизации, раскрытия цикла, сжатия и расширения цикла и некоторые другие.

2. По характеру атакующих частиц – реагентов (по типу разрыва связей).

Бывают гомолитическими (или радикальными) и гетеролитическими (или полярными), которые рассмотрим ниже.

В реакциях принято различать атакуемое вещество – субстрат и атакующее вещество (или частицу) – реагент. В зависимости от характера реагента различают реакции нуклеофильные, радикальные и электрофильные. Часто эту классификацию сочетают с классификацией по направлению реакции, что обычно и используют в органической химии. Тогда говорят о реакциях радикального присоединения (A_R), электрофильного присоединения (A_E), нуклеофильного присоединения (A_N), радикального замещения (S_R), нуклеофильного замещения (S_N), электрофильного замещения (S_E), где A,S,E – тип реакции, а индексы R,N,E – тип атакующей частицы (реагента)

3. По молекулярности реакции.

«Молекулярность» реакции указывает на число молекул, в которых происходит изменение ковалентных связей в стадии, определяющей (лимитирующей) суммарную скорость реакции – самой медленной стадии реакции. Если в стадии, лимитирующей скорость реакции, участвует одна молекула, то реакцию считают мономолекулярной, если две – то бимолекулярной. Полимолекулярные реакции встречаются очень редко.