Морган скрещивал черных длиннокрылых самок с серыми самцами с зачаточными крыльями. В первом поколении все потомство было единообразным – серым длиннокрылым. Затем , он снова произвел анализирующие скрещивание, только из первого поколения отобрал не самца, а самку и скрестил ее с черным самцом с зачаточными крыльями. В этом случае появилось потомство не двух, как при полном сцеплении, а четырех типов: серое с зачаточными крыльями, черное длиннокрылое, серое длиннокрылое и черное с зачаточными крыльями, но не в равных соотношениях, как при независимом комбинировании признаков, а со значительным преобладанием фенотипов сходными с родительскими формами. 41,5% мух серых с зачаточными крыльями, как у одного исходного рордителя, и 41,5% особей черных длиннокрылых, как у другого исходного родителя. Только у 17% потомков родилось с новыми сочетанием признаков: 8,5% черных с зачаточными крыльями, 8,5% серых длиннокрылых. Таким образом, 83% потомков имели сочетание признаков, как у исходных родительских форм, но появились особи с новым сочетанием признаков. Следовательно, сцепление является неполным.
P ♀ bbVV × ♂ BBvv
g bV Bv
F1 ♀ BbVv × ♂ bbvv
g bV Bv BV bv bv
bbVv Bbvv BbVv bbvv
41.5% 41.5% 8.5% 8.5%
Чтобы объяснить происходящее явление Томас Морган обратился к теории хиозмотипий бельгийского цитолога Янсена (он наблюдал, что при сперматогенезе саламандры в профазе мейоза гомологичные хромосомы конъюгируют, а затем, при начале расхождения, образуют х-образные фигуры-хиазмы ).На основании этой теории Морган высказал гипотизу о том, что при образовании хиазм гомологичные хромосомы обмениваются участками. Если сцепленные гены лежат в одной хромосоме и у гетерозигот при образовании гамет происходит рекомбинация этих генов, значит, гомологичные хромосомы во время мейоза обменялись своими частями. Обмен гомологичных хромосом частями называется перекрестом или кроссинговером. Особей с новыми сочетаниями признаков, образовавшихся в результате кроссинговера, называют кроссоверами. Кроссинговер приводит к измению групп сцепления и расширяет возможности комбинативной изменчивости.