Клетки прокариот, к которым относятся бактерии, имеют относительно простое строение. Цитоплазма прокариотической клетки значительно беднее по составу по сравнению с эукариотической клеткой.
| Признаки | Прокариоты | Эукариоты |
| Клеточная мембрана | + | + |
| Цитоплазма | + | + |
| Ядерная оболочка, ядро | - | + |
| ДНК | Замкнута в кольцо (условно называют «бактериальная хромосома») | Ядерная ДНК представляет линейную структуру и находится в хромосомах |
| Хромосомы | - | + |
| Митохондрии | - | + |
| Пластиды у автотрофов | - | + |
| Эндоплазматическая сеть | - | + |
| Комплекс Гольджи | - | + |
| Рибосомы | + (но более мелкие) | + |
| Жгутики, реснички | + | + |
| Клеточный центр | - | + |
| Включения | + | + |