РНК как двойная спираль

В зависимости от биологической функции природные РНК представляют собой двойную спираль, либо имеют глобулярную структуру, в которой короткие двухцепочечные фрагменты образуются при сворачивании в компактную структуру одной цепи.

Начнем с двойной спирали. В отличие от ДНК двуцепочечная природная РНК имеет только две очень близкие структуры, называемые спиралью А и спиралью А'. В зависимости от концентрации соли в среде двойные спирали РНК находятся в одной из двух структурно близких форм. При низкой ионной силе преобладает двойная спираль А-РНК с 11 парами оснований на виток. При повышении концентрации соли А-РНК переходит в А', у которой на виток приходится 12 пар оснований. Пары оснований смещены относительно оси спирали на величину около 4 Å, поэтому главный (большой) желобок получается очень глубоким, а минорный (маленький) – мелким. Основное различие между А и А'-РНК заключается в неодинаковом шаге спирали: для А-РНК он равен 30 Å, а для А'-РНК – 36 Å (рис. 3.16).

Рис. 3.16. Схематическое представление А и А` форм РНК

 

РНК не образует длинных спиралей. Для нее типично образование длинных спиралей с ДНК, в которой одна цепь состоит из РНК, а другая из ДНК. Такой процесс называется гибридизацией и играет важную роль в процессах транскрипции и трансляции. Однако РНК способна образовывать короткие спирали сама с собой, образуя тяжи и петли.