Химически связанная вода принимает участие в строении кристаллической решетки в виде молекулы (Н2О), гидроксила (ОН-), водорода (Н+) и оксания (Н3О+). Подразделяется такая вода на конституционную(диаспор – AlOOH), которая выделяется из минерала в пределах от 300° до 1000°С; кристализационную (гипс – CaSO4. 2H2O), температура удаления не более 300 ° С и цеолитную воду (опал SiO2 nH2O), выделяемую при меньших температурах (100°С-50°С) и легче восстанавливаемую. Как правило, удаление воды из кристаллической решетки минералов влечет за собой перестройку последней.
Таким образом, наличие в горных породах тех или иных видов воды во многом предопределяет как основные водные свойства горных пород, так и условия движения подземных вод.