Месторождения магнетитовых руд выявлены в Кузнецком Алатау, в Западном Саяне и на Алтае.
Месторождения полиметаллов открыты в девонских осадочно-эффузивных толщах Рудного Алтая. В полиметаллических рудах содержатся сульфиды цинка, свинца и меди, а также серебро и кадмий.
Медные руды содержатся в отложениях верхнего девона Иртыш-Зайсанской зоны.
В этой же зоне обнаружены месторождения вольфрама, молибдена и олова.
К офиолитовым поясам на Урале приурочены месторождения хрома.
Месторождения марганца связаны с кембрийскими отложениями Кузнецкого Алатау.
Коренные и россыпные месторождения золота связаны с Салаиро-Западносаянской складчатой областью.
Салаирским и Западно-Саянским глубинными разломами связаны ртутно-рудные пояса.
В Томь-Колыванском антиклинории находится месторождение касситерита.
Месторождения асбеста связаны с Кузнецким Алатау, Западно-Саянским и Тувинским районами.
В Кузнецком прогибе расположен Кузнецкий каменноугольный бассейн. Основные эксплуатационные горизонты связаны с каменноугольной пермской и юрской толщами. В Томь-Колыванской зоне расположен Горловский каменноугольный бассейн. Значительные скопления углей выявлены в Минусинских и Тувинской впадинах.