С раннего докембрия до позднего карбона на большей части территории развивалась Верхояно-Колымская платформа. В конце байкальского тектонического этапа в ее структуре обособились Колымский и Чукотский массивы, а в конце каледонского этапа – Омолонский массив. В течение и раннего палеозоя внутри структуры срединных массивов, в раннем карбоне между Сибирской и Китайской платформой и жесткими срединами закладывается Верхояно-Чукотская геосинклиналь с типичным миогеосинклинальным характером развития. В конце начале мела происходит замыкание геосинклинали и складчатости.
В результате мощного мезозойского тектогенеза Верхояно-Чукотская геосинклиналь замкнулась и вновь сформировавшиеся складчатые структуры присоединились к более древним сооружениям и платформам. На орогенном этапе формируется Предверхоянский краевой прогиб, и развиваются крупные межгорные впадины, выполненные молассами. С позднего мела в Верхояно-Чукотской складчатой системе наступают условия близкие к платформенным, сглаживается рельеф и формируется кора выветривания.
В новейшее время произошли опускания, и формирования материковой отмели на севере. А на юге произошли опускания и затопление большей части Охотского массива. Наблюдалось оживление глубинных разломов, сопровождавшееся сейсмичностью и образованием вулканических очагов. Сформировался среднегорный рельеф.