Развитие железнодорожного сообщения. Строительство Самаро-Златустовской железной дороги сыграло огромную роль в подъеме экономической и культурной жизни Уфы. Общественность города, городское управление более 10 лет добивалось проведения Сибирской железной дороги через Уфу. 9 января 1885 года правительство утвердило проект железной дороги Самара - Уфа - Златоуст - Челябинск - Екатеринбург. 23 октября 1885 года начались строительные работы на Самаро-Уфимском участке дороги.
Торжественная закладка вокзала и других железнодорожных сооружение в Уфе состоялась 26 апреля 1886 года. Строительство велось высокими темпами. Движение на Самаро-Уфимском участке открылось 8 сентября 1888 года. В этот день строители передали железнодорожникам мост через р. Белую. А ровно через два года, 8 сентября 1890 года, были приняты в эксплуатацию Уфимско-Златоустовский участок дороги и мост через р. Уфу. На строительстве Уфимско-Златоустовского участка дороги инженером-изыскателем работал писатель Н.Г.Гарин-Михайловский.
В своих произведениях заключительная часть известной тетралогии Инженеры, рассказ Вариант и др. он использовал эпизоды и опыт этой своей деятельности, неоднократно бывал в Уфе по делам службы. В августе 1888 года в Уфе вступили в строй главные мастерские Самаро-Златоустовской железной дороги ныне Тепловозоремонтный завод и депо. Мастерские состояли из трех отдельных зданий, в которых размещалось 5 цехов и 4 отделения.
В 1889 году в них трудилось 167 рабочих, в дальнейшем их число резко возросло. В 1890 году мастерские были оснащены передовой по тому времени техникой и производили работы по капитальному ремонту и сборке паровозов, вагонов и котлов. Население Уфы. Население города росло высокими темпами. За 33 года его численности увеличилась в 2,5 раза. В основном население пополнялось за счет переселенцев из других мест. К концу XIX века Уфа становится многонациональным городом, хотя русское население остается безусловно преобладающим.
В 1897 году русские, украинцы и белорусы составляют 85,36 населения Уфы, остальное - башкиры, татары и другие народности. Управление городом. На основе нового городового положения, утвержденного Александром II в 1870 году, была проведена реформа городского самоуправления. Выборы по новому положению в Уфе состоялись с 25 ноября по 16 декабря 1870 года. Избиратели были разделены на 3 отдельные курии собрания. Первая курия состояла из крупнейших собственников, уплачивающих треть общей суммы городских налогов 31 человек.
Ко второй курии относились владельцы средних состояний, также совместно вносивших треть поступающих с избирателей налогов 118 человек. К третьей курии относилось все остальное население, имевшее избирательное право 1126 человек. Они избрали 69 гласных городской думы, по 23 от каждой курии. В думе первого созыва заседали 40 купцов и почетных граждан, 17 дворян и чиновников, 1 представитель духовенства и 11 мещан и крестьян.
Дума выделила городскую управу в составе городского головы, трех членов и секретаря. Дума и ее управа ведали городским хозяйством, благоустройством города, торговлей, промышленностью, больницами, школами и прочее. Основными источниками денежных средств думы городского бюджета были специальные сборы с недвижимого имущества горожан, торговли и промыслов, доходы от городских земель, предприятий и сооружений, отчисления из годовой прибыли городского банка и т.д. Деятельность городской думы протекала под постоянным контролем губернатора и специального административного учреждения - губернского по городским делам присутствия.
Просвещение и культура. В 1864 году статистический комитет основал в Уфе губернский краеведческий музей. В 1886 году в одном из зданий Верхне-Торговой площади он был открыт для посетителей. В 1865 году, в связи с разделением Оренбургской губернии на Уфимскую и Оренбургскую, выходившая в Уфе еженедельная газета Оренбургские губернские ведомости была переименована в Уфимские губернские ведомости.
С июля 1894 года газета стала ежедневной. В 1879-1883 годах издавался ежемесячный журнал Вестник Уфимского земства, а в 1879 году начал выходить 2 раза в месяц журнал Уфимские епархиальные ведомости. Все издания были на русском языке. В 1876 году на месте сгоревшего здания театра женской гимназии по проекту губернского архитектора Р.О.Карвовского было построено новое двухэтажное здание театра на 800 мест. Так как постоянного профессионального театрального коллектива в Уфе не было, здание задавалось в аренду гастролирующим труппам. С сентября 1890 года по май 1891 года в помещении театра выступала оперная труппа антрепренера Семенова-Самарского, в состав которой в Уфе был принят тогда еще никому не известный 17-летний хорист Федор Шаляпин 1873-1938. Здесь, заменяя заболевшего артиста, он исполнил свои первые партии - Стольника в опере Галька С.Монюшко и Фернандо в опере Трубадур Д.Верди. В 1862 году в Уфе, в интеллигентной купеческой семье родился известный художник М.В.Нестеров.