Морские млекопитающие. Определение морских млекопитающих в естественных условиях проводится по всему комплексу внешних, видимых над водой признаков (силуэт, фонтан, размер, форма и окраска тела, форма и окраска плавника и хвостовой лопасти) и особенностей поведения (ныряние, передвижение, кормление и т.д.). Сопоставление со сведениями об особенностях поведения, а также вероятность встречи животного в конкретном районе позволяют идентифицировать его видовую принадлежность.
Определение видового состава птиц производится, преимущественно, визуальными наблюдениями с использованием определителей. Наряду с традиционными методами изучения морской биоты в настоящее время используют методы долгосрочных подводных трансект. Так, в заливе Петра Великого установлены долгосрочные подводные трансекты, захватывающие все типы донных ландшафтов, вдоль которых проводится сезонный видеомониторинг гидробионтов.
Одновременно из районов установки трансект проводится сбор биоты (зоопланктон, макробентос, мейобентос, ихтиофауна) по стандартным методикам, рекомендованным международными организациями DIWPA и NaGISA. Для районов трансект подготовлены видовые списки по основным группам морских организмов.