Критерии выбора биоиндикаторов среди растений остаются такими же, как и в случае млекопитающих и других животных. При биоиндикации загрязнения почв и снега тяжелыми металлами в настоящее время во многих странах используют зеленые мхи рода Pleurozium, а также лишайники рода С1аdonia, широко представленные в лесах бореальной зоны. При движении с севера на юг биомасса этих растений в лесах уменьшается и в напочвенном покрове начинают преобладать травы. Как было недавно показано, некоторые из травянистых растений, например одуванчик (Таrахасит) или подорожник (Р1апtago), также могут служить для индикации загрязненности соединениями тяжелых металлов.
Во многих регионах Северного полушария в настоящее время происходит постепенное расширение зоны деградации лесных экосистем. Этот факт не может быть объяснен действием таких отдельно взятых негативных факторов, как увеличение кислотности атмосферных осаждений, увеличение содержания в воздухе фитотоксичных фотооксидантов или выпадение соединений тяжелых металлов, т.е. наблюдается синергизм. Традиционные приемы мониторинга состояния лесов, основанные на выявлении морфологических изменений, регистрируют уже далеко зашедшие последствия антропогенных воздействий и непригодны для индикации начальных этапов деградации лесных экосистем. Однако морфологическим изменениям предшествуют сдвиги в метаболизме в растительных тканях, и на этом может быть основано выявление ранних стадий повреждений.