Основополагающий принцип, который соблюдался при проектировании и разработке системы режима S вторичных радаров (SSR), заключается в том, что режим S должен быть полностью совместим с режимами A и C SSR. Такая совместимость требует того, чтобы наземные станции ВОРЛ, функционирующие только в режимах A и C, получали правильные ответы в режимах A и C от оснащенного оборудованием режима S воздушного судна без внесения изменений в наземное оборудование, и чтобы не требовалось модифицировать приемоответчики режима A/C для получения обслуживания в режиме наблюдения от наземной станции режима S.
Для режима S были приняты те же самые несущие частоты, которые используются для режимов A и C (1030 МГц для запросов и 1090 МГц для ответов). Были разработаны специальные меры для обеспечения того, чтобы две системы могли сосуществовать при использовании тех же частот, не создавая взаимных помех. Необходимо было предотвратить ненужное срабатывание приемоответчиков режима A/C за счет сигналов запроса в режиме S. Это было достигнуто за счет передачи в начале каждого запроса в режиме S пары импульсов одинаковой амплитуды с интервалом в 2 мкс между ними. Таким же образом передается пара импульсов подавления боковых лепестков (SLS), которая вызывает подавление приемоответчиков режима A/C в течение 35 ± 10 мкс. Запрос в режиме S завершается в пределах номинального периода подавления. Хотя приемоответчики с минимальным допустимым временем подавления, равным 25 мкс будут, тем не менее, детектировать конец импульса P6 в режиме S, однако не будут срабатывать, поскольку остающаяся часть импульса P6 не является достаточно продолжительной, чтобы имитировать получение запроса в режиме A. Для включения в сообщения 24-битового адреса и достаточного объема данных в пределах периода подавления, была выбрана скорость передачи данных по линии связи "вверх", равная 4 Мбит/с. Скорость передачи данных, равная 1 Мбит/с, используется для ответов с тем, чтобы ответные импульсы в режиме A/C и режиме S могли быть генерированы одним и тем же передатчиком.