Вторым вопросом, возникающим в процессе применения КН, является проблема оценки товаров, или, точнее, определения их таможенной стоимости. Так как большинство пошлин, применяемых в ЕС, являются адвалорными (ad valorem), необходимо определить цену, по которой будет применяться процентная таможенная ставка. "Регламент" ЕС, касающийся оценки товаров (№ 1224/80), основан на так называемом Кодексе таможенной оценки товаров ГАТТ, который был принят в 1979 г. на Токийском раунде многосторонних торговых переговоров. Существенная черта этого кодекса состоит в требовании, чтобы нормальная "цена сделки", т. е. цена, в настоящее время уплачиваемая покупателем товара, должна быть основой таможенной оценки товара. Прежде чем принять кодекс, ведущие торговые державы использовали множество различных методов таможенной оценки товаров. Например, в ЕС применялся метод так называемой "нормальной цены", который означал, что таможенная цена товара могла быть больше, чем цена, уплачиваемая за него в данный момент, если таможенные власти полагали, что на почтительном расстоянии от места совершения сделки товар обычно продается за более высокую цену.
В настоящее время в ЕС применяется цена сделки или цена накладных, а не "нормальная цена", подсчитываемая таможенными служащими. Когда цена сделки не принимается во внимание в качестве альтернативного метода, предлагается сложение стоимостей. В редких случаях могут использоваться методы определения таможенной стоимости по цене сделки с идентичными или однородными товарами или даже метод вычитания стоимости. Нет нужды подробно раскрывать содержание этих методов, поскольку они восприняты Таможенным кодексом РФ 1993 г. Ясно, что такое изменение методов определения цены сделки благоприятствует импортерам и значительно сокращает усмотрение таможенных служащих в вопросах таможенной оценки товаров.