NS 1. Состоит из двух доменов: N-концевой обладает метил-трансферазной активностью, а С-концевой – гуанилтрансферазной. Это кэпирующий фермент. Отличается последовательность реакций синтеза кэпа: если в клетке сначала происходит присоединение гуанила, а потом его метилирование, то вирусный фермент сначала метилирует гуанин, а потом присоединяет его к 5’-концевому нуклеотиду. Подобный кэпирующий фермент есть у Poxviridae, аналогично ему NS1 (уточнить!!!) может выполнять и другие функции, например, участвовать в регуляции репликации.
NS2 (P2). Обладает тремя активностями: хеликазной, протеазной и γ-фосфатазной. Участвует в кэпировании РНК, процессинге полипротеина.
NS3 (P3). Возможно, он регулирует активность NS2, предполагается, что он может служить мембранным якорем, потому что имеет высокогидрофобные учаскти. И все же его функции не известны.
NS4 (P4). РНК-зависимая РНК-полимераза.
Временная регуляция синтеза РНК α-вирусов.
В клетках пораженных α-вирусами на первой стадии происходит преимущественный синтез (-) цепей. На второй стадии прекращается синтез (-) цепей РНК и происходит накопление (+) цепей геномной РНК. На третьей стадии синтезируются (+) цепи геномной РНК и субгеномная РНК.
У некоторых α-вирусов между генами NS3 и NS4 находится терминирующий кодон. Он преодолевается полимеразой за счет его супрессии.