Багатофункціональні системи для функціональних досліджень розрізняються набором вимірюваних параметрів, обумовлених конкретним призначенням системи.
Апаратне забезпечення зазвичай включає персональний комп’ютер або кілька комп’ютерів, об’єднаних у комп’ютерну мережу, а також комплекс пристроїв перетворення і введення в комп’ютер біосигналів різної природи.
Інтеграція результатів медичних досліджень, отриманих різними методами, вимагає вирішення ряду задач, пов’язаних з уніфікацією програмно-апаратних засобів діагностуючих приладів. Тому важливою особливістю програмного забезпечення багатофункціональних систем є наявність програми-оболонки, що забезпечує збереження й оперативний доступ до даних пацієнта, звернення до будь-якої, включеної до складу системи, методики дослідження, автоматичне формування документів статистичної звітності. Основна відмінність багатофункціональних систем від аналогічного набору спеціалізованих систем полягає в тому, що в багатофункціональній системі всі методики дослідження об’єднані єдиною базою даних. Крім того, досить зручною є уніфікація для всіх методик інтерфейсу спілкування з користувачем (наприклад, натиснення певної клавіші для різних методів має одне й те ж саме значення).