Велика концентрація масивів медичної інформації, відсутність елементарного контролю за її збереження та відносно низький рівень надійності технічних засобів викликають серйозну тривогу в забезпеченні збереження інформації.
В процесі експлуатації МІС, інформація, що накопичується і обробляється, є досить вразливою, підданою до руйнування, так і несанкціонованого використання. А велика кількість різноманітних компонентів, операцій, ресурсів і об’єктів МІС створює досить привабливе середовище для різного роду вторгнень та несанкціонованих дій.
Виділяють такі основні проблеми, що виникають в процесі захисту інформації в МІС:
- попередження витоку, кражі, втрати, викривлення, підробки інформації;
- попередження загроз безпеки інформації особистості, суспільства, держави;
- попередження несанкціонованих дій по знищенню, модифікації, викривленню, копіювання, блокування інформації;
- попередження різних форм незаконного втручання в інформаційні ресурси та інформаційні системи;
- забезпечення правового режиму використання документованої інформації як об’єкта власності;
- захист конституційних прав громадян на збереження особистої таємниці та конфіденційності персональних даних, що містяться в інформаційних системах;
- збереження лікарської таємниці, конфіденційності документованої інформації у відповідності з законодавством України;
- гарантія прав суб’єктів в інформаційних процесах та при їх розробці, виробництві та застосуванні інформаційних систем, технологій і засобів їх забезпечення.
Слід зазначити, що сьогодні в якості базового рівня МІС застосовуються звичайні (побутові) ПК, котрі об’єднують за допомогою додаткового обладнання в локальні та розподілені обчислювальні мережі. Для захисту інформації при такому підході приходиться витрачати невиправдано велику кількість засобів на організацію захисту цінної інформації, що обробляється за допомогою дешевої техніки. А в умовах, коли користувачі мають доступ до декількох серверів і володіють правами віддаленої реєстрації, захист настільки ускладнюється, що його забезпечення стає не по кишені навіть потужним фірмам та великим медичним центрам.