В цьому модулі зазвичай здійснюється вибір методики дослідження пацієнта. Далі вибирають кількість каналів постування інформації, що реєструється в даному дослідженні. Встановлюють характеристики каналів, коефіцієнти їх посилення, частоти дискретизації та ін. Проводять установку датчиків на пацієнті та їх підключення до системи. Встановлюють режими виконання дослідження, характеристики функціональних проб, режими запису в буфер, відображення даних на екрані монітору. Крім того, заповнюється паспортний бланк досліджуваного. Всі ці налагодження запам’ятовуються в файлі і в подальшому виконуються автоматично.