Район имеет довольно развитую гидрографическую сеть, принадлежащую р. Тобол. Главной водной артерией района является р. Уй. Средняя извилистость р.Уй 1,25. Относительный уклон 0.004. Остальные реки (Агыр, Увелька, Каморза, Калиновка, Иматка, Кидыш, Суясна, Молочная, Топкая и др.) отнесены к малым, они немноговодны, пересыхают в летний засушливый период. Крупных водохранилищ и озер в районе нет. На притоках рек Уй и Увелька расположено более 240 прудов, из них крупных водоемов – 37. На 6 водоемах, которые находятся в аренде, арендаторы занимаются рыборазведением.
Питание рек осуществляется в основном за счет таяния снегов и летних атмосферных осадков.
Наибольший расход воды бывает в апреле 22,6 м/сек.. а минимальный в январе-феврале 0,22 м/сек.
Срок вскрытия р.Уй у с. Уйское 14 апреля , замерзания 6 ноября. Количество воды в реках находится в прямой зависимости от выпадающих атмосферных осадков. При общем поверхностном слое с листа 180,75 куб.км. в год или 36,2% количества выпадающих осадков.