Применение системного подхода к транспорту предполагает его учёт при его анализе следующих положений:
1. Транспортная система относится к сложным системам, поэтому транспортную систему необходимо рассмотреть с позиции системы более высокого порядка, с позиций народного хозяйства в целом.
Аналогично в отношении подсистем и элементов транспортных подсистем.
2. Необходимо учитывать наличие различных типов структур транспортных систем (технической, технологической, территориальной, географической)
3. Необходимо учитывать как относительную самостоятельность транспортной системы, так и его тесную связь с другими отраслями.
4. Необходимо учитывать свойства управляемости транспортной системы, высокий уровень его организации.
5. Транспорт является динамической системой.
С точки зрения системных принципов транспортная система - техническое, технологическое, экономическое, организационное, правовое и территориальное единство различных видов транспорта.
По своей географической структуре, транспортная система состоит из железнодорожного и автомобильных магистралей, водных и воздушных трасс, нефтепроводов, газопроводов, нефтепродуктопроводов.
Составные части транспортной системы – транспортные узлы.