Поверхностные водоемы, используемые для купания, часто бывают сильно загрязнены микроорганизмами. Величина риска бактериального загрязнения в местах купания людей определяется прежде всего типом водоема (море как открытая система, пресные водоемы, ограниченные берегами, стоячие или проточные). Загрязнение водоемов недостаточно очищенными сточными водами ведет главным образом к желудочно-кишечным заболеваниям, причем уровни загрязнения коррелируют с обилием фекальных стрептококков.
формирование микрофлоры мелких водоемов и прибрежной зоны морей зависит от многих факторов, основными из которых являются следующие:
В водоемах происходят процессы самоочищения. Однако при массивных загрязнениях они могут быть сведены к нулю. Нередко в водоемах обнаруживаются сальмонеллы, вызывающие кишечные заболевания.
Морские прибрежные воды обычно содержат небольшое количество сальмонелл, но в конце лета их в 1 ООО раз больше, чем весной и поздней осенью. Возможно, такая сезонность отображает их циркуляцию среди людей и животных. Биологическая очистка стоков не вызывает полной гибели сальмонелл. Наиболее часто они обнаруживаются не только вблизи выпуска стоков, но и на расстоянии 400 м от берега.
Водный путь передачи инфекции играет важную роль в распространении холеры. Холерные вибрионы нередко встречаются в водоемах эндемичных очагов и других районов. Среди обнаруживаемых в водоемах вибрионов помимо патогенных холерных и сапрофитных водных могут встречаться некоторые другие вызывающие заболевания у людей вибрионы.
В водоемы патогенные бактерии в основном попадают извне и через определенное время отмирают. И только некоторые патогенные организмы способны размножаться в воде. Так, при использовании некоторых систем центрального кондиционирования, оборудованных системами оборотного водоснабжения с градирнями, возможно возникновение болезни легионеров, поражающей легочную ткань. В России таких кондиционеров практически нет и До настоящего времени не зарегистрировано ни одного случая этого заболевания.