Объем биоаккумуляции вредного вещества зависит от его свойств, условий ОС, экзогенных факторов и эндогенных факторов самого организма.
Вредные вещества могут поступать из воды и воздуха (прямое поступление) или по цепи питания (косвенное поступление). Баланс между процессом поступления вредного вещества с одной стороны и накоплением и выведением с другой в большей степени зависит от внутренних процессов в организме, т.е. от его способности к накоплению и выделению вредных веществ. Некоторые организмы создали определенные механизмы поддержания процесса накопления в определенных границах.
Например, рыбы и ракообразные перерабатывают ароматические углеводороды легче, чем большинство моллюсков. Кроме того, организм рыбы способен регулировать содержание цинка и меди в мышцах, но не может делать этого в отношении ртути. При очень малых дозах воздействия металлов, некоторые ферменты осуществляют отложения металлов про запас, причем откладывают эти металлы в форме металлорганических соединений, содержащих серу. Тиольные группы меркаптанов (улавливание Hg) имеют кислотные свойства и образуют с ионами тяжелых металлов соли –меркоптиды. Эта реакция соответствует одному из самых известных конкурентных путей торможения активности ферментов. Металлорганические соединения, содержащие серу, называют – металлотионинами. Цианиды тормозят ферментативные реакции различными путями: образуют стабильные комплексы со многими ионами металлов, либо устраняют их и переводят фермент в дезактивируемую форму. Т. к. ферменты катализируют тысячи химических реакций, любое изменение в их структуре влияет на их специфичность и регуляторные свойства.