Вторая гражданская война. Положение в Англии в конце 1647 года было очень напряжённым: король заключил договор с шотландцами, с помощью которых он планировал вернуть себе власть; это в свою очередь способствовало росту активности роялистов, пытавшихся поднять восстания в нескольких регионах страны.
В апреле следующего года становится известным о приготовлениях шотландцев. В связи с угрозой войны свои усилия объединили левеллеры и индепенденты, между которыми происходили разногласия из-за нерешительных действий последних по продолжению революции. В то же время пресвитериане, не желавшие конфронтации с королём, служили главным «тормозом» этой войны.
Территориями, где проходили основные столкновения с Карлом и поддерживающими его людьми стали Кент, Южный Уэльс – там сумели поднять мятежи сторонники короля - и северные границы Англии, находившиеся под угрозой шотландского вторжения. Пока Томас Ферфакс (1612-1671) подавлял сопротивление на юго-востоке Англии, Кромвель расправился с восстанием в Уэльсе, а затем двинулся на север, где сумел одержать победу над объединёнными силами шотландцев и роялистов (Гамильтон и Лангдейл), значительно превосходившими его войска по численности (в частности 17 августа 1648 года в битве при Престоне), что явилось его первым крупным самостоятельным успехом в качестве полководца. После этого сражения Кромвель совершил поход в Шотландию, в результате которого без особого противодействия дошёл до Эдинбурга и заручился там поддержкой, в то время как шотландская армия была распущена по домам.
Оттуда он отправился на север страны к продолжавшей сопротивляться крепости Понтекрафт, остававшейся единственной сопротивляющейся точкой, и штурмом взял её. Фактически же война окончилась в конце лета – начале осени с капитуляцией 31 августа Колчестера под напором сил Ферфакса и изгнанием шотландцев.