Контрольные функции Федерального казначейства. За Федеральным казначейством Кодекс закрепил предварительный и текущий контроль за ведением операций с бюджетными средствами всеми участниками бюджетного процесса.
При осуществлении контроля казначейство должно взаимодействовать с другими федеральными органами исполнительной власти и координировать их работу. Последнее положение также явилось нормативным новшеством. Кодекс решил в законодательном плане вопрос об обязательности ведомственного или внутреннего контроля. Главным распорядителям и распорядителям бюджетных средств было вменено в обязанность осуществлять контроль за использованием этих средств их подведомственными получателями.
Прежде всего должны обеспечиваться и проверяться целевое использование и своевременный возврат бюджетных средств, а также представление отчетности и внесение платы за пользование бюджетными средствами.