На этот департамент возложено организационное обеспечение деятельности большинства федеральных судов общей юрисдикции (нередко и мировых судей) и органов судейского сообщества. Из сферы его деятельности полностью исключены Конституционный Суд РФ, Верховный Суд РФ и Высший Арбитражный Суд РФ, которые в соответствии с ч. 1 ст. 30 Закона осудебной системе сами обеспечивают свои организационные потребности с помощью аппаратов судов.
Судебный департамент возглавляет органы и учреждения, входящие в его систему. В соответствии со ст. 2 Закона о Судебном департаменте при ВС РФ его система включает:
центральный аппарат Судебного департамента;
управления (отделы) Судебного департамента в субъектах РФ;
органы и учреждения Судебного департамента.
Центральный аппарат Судебного департамента состоит из ряда структурных подразделений, призванных обеспечивать выполнение всех его функций, например:
главного управления организационно-правового обеспечения деятельности судов;
главного управления обеспечения деятельности военных судов;
главного финансово-экономического управления;
управления государственной службы и кадрового обеспечения;
контрольно-ревизионного управления;
управления делами и др.
Возглавляет Судебный департамент Генеральный директор, назначаемый Председателем Верховного Суда РФ с согласия Совета судей РФ. На него возложена ответственность за надлежащую организацию выполнения возложенных на Судебный департамент и его органы функций по организационному обеспечению деятельности судов. Издаваемые им приказы, распоряжения и инструкции обязательны и для судов в части, касающейся организационного обеспечения их деятельности. Ежегодно он должен представлять отчеты о деятельности Судебного департамента Председателю Верховного Суда РФ, а также отчитываться перед Всероссийским съездом судей.
Местные органы Судебного департамента — управления (отделы) — обеспечивают выполнение задач в сфере организационного обеспечения деятельности судов общей юрисдикции на территории субъекта РФ. Возглавляют их начальники, назначаемые Генеральным директором по согласованию с председателями судов, советами судей и органами государственной власти субъектов РФ.
В соответствии со ст. 1 Закона о Судебном департаменте при ВС РФ его задачами являются:
организационное обеспечение деятельности верховных судов республик, краевых и областных судов, судов городов федерального значения, судов автономной области и автономных округов, районных судов, военных и специализированных судов (т.е. федеральных судов), органов судейского сообщества;
финансирование мировых судей;
формирование единого информационного пространства федеральных судов общей юрисдикции и мировых судей.