На XXVII съезде КПСС в 1986 г. М.С. Горбачев говорил: «Мы хотели бы, чтобы уже в самом близком будущем вернулись на родину советские войска, находящиеся в Афганистане по просьбе его правительства». Прогресс в советско-американских отношениях позволил перейти к практическим шагам. 8 февраля 1988 г. Горбачев заявил, что правительства СССР и Афганистана договорились начать вывод советских войск 15 мая 1988 г. В Женеве 14 апреля 1988 г. были подписаны документы по вопросам политического урегулирования вокруг Афганистана. Данные документы не касались внутренних проблем Афганистана. Вступив в силу 15 мая 1988 г., эти соглашения регламентировали процесс вывода советских войск и декларировали международные гарантии о невмешательстве, обязательства по которым приняли на себя СССР и США. 15 февраля 1989 г., как предусматривалось Женевскими соглашениями, из Афганистана были выведены последние советские войска.
В декабре 1989 г. II Съезд народных депутатов СССР своим постановлением «О политической оценке решения о вводе советских войск в Афганистан в декабре 1979 года» осудил и признал грубой политической ошибкой «необъявленную войну» в Афганистане. В Афганистане погибло 15 051 советских граждан. С 1989 по 1991 г. просоветскому правительству Кабула Советский Союз оказывал главным образом материальную помощь.